LXL04_026270 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_026270

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 124135864-124138472 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2140 bp · LXL04_026270|LXL04_026270|OH1004|cDNA

ATGGAGACTCAATCAGAAAGCACGGACGAAATTGCGAACATCAAAGAAATTCGGCAACAAATCCAGTCTCGTATTGAAACGCTACGAAATTCTCAGCTCGAAGTTATATCGTCTCTCCAGTATGGTGTAGTTCCAGACATTACATCGTCTCTCGATCTCCATCTCCAAGTCGTTTCCTCCTTCAATGGCCGCCCATTCACCCCTTTACCTAACCCTCTTCCCGCCCCCAACCCTAATACTAGACGACGCATTCAACCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2127 bp · LXL04_026270|LXL04_026270|OH1004|CDS

ATGGAGACTCAATCAGAAAGCACGGACGAAATTGCGAACATCAAAGAAATTCGGCAACAAATCCAGTCTCGTATTGAAACGCTACGAAATTCTCAGCTCGAAGTTATATCGTCTCTCCAGTATGGTGTAGTTCCAGACATTACATCGTCTCTCGATCTCCATCTCCAAGTCGTTTCCTCCTTCAATGGCCGCCCATTCACCCCTTTACCTAACCCTCTTCCCGCCCCCAACCCTAATACTAGACGACGCATTCAACCACC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

708 aa · LXL04_026270|LXL04_026270|OH1004|PROTEIN

METQSESTDEIANIKEIRQQIQSRIETLRNSQLEVISSLQYGVVPDITSSLDLHLQVVSSFNGRPFTPLPNPLPAPNPNTRRRIQPPPPAPTIKISKLSDDLHTRPSADDFTGDEVGGGTTPLSTVRSMVAVCLLERVPFTEIDSASILSKLESDSFQSVTTAEKATLREVAGGEPILAVEMALRAMAEDNGGVQFEEFKMNGKFRVLVKGIDRTKLVKELPESKPNESNSNNSSGGNAIQQSSRAIGDGGWMGQGDASQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_026270`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_026270

位置 Chr05:124135864-124138472 (-)

描述 Similar to MTA: N6-adenosine-methyltransferase MT-A70-like

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g10760`	N6-甲基转移酶复合物的催化亚基，这是一个多蛋白复合物，介导某些 mRNA 在 5'-[AG]GAC-3' 共识位点的 N6-甲基腺苷 (m6A) 甲基化。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0672600`	可能的 N6-甲基转移酶，可甲基化某些 mRNA 的腺苷残基。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026270 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程

GO:0001510 RNA methylation 生物过程

GO:0006397 mRNA processing 生物过程

GO:0006402 mRNA catabolic process 生物过程

GO:0006406 mRNA export from nucleus 生物过程

GO:0006974 DNA damage response 生物过程

GO:0007283 spermatogenesis 生物过程

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程

GO:0016556 mRNA modification 生物过程

GO:0019827 stem cell population maintenance 生物过程

GO:0031053 primary miRNA processing 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G10760

dosa:Os02g0672600

hsa:56339

mmu:56335

mtr:11429893

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.884

排名 1 · LXL04_026270 · OH-1004

细胞质0.216

排名 2 · LXL04_026270 · OH-1004

线粒体0.031

排名 3 · LXL04_026270 · OH-1004

细胞膜0.020

排名 4 · LXL04_026270 · OH-1004

内质网0.013

排名 5 · LXL04_026270 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05063.21MT-A70486-646 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_026270	`PF05063.21`	MT-A70	486	646	2.6e-61	207.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O82486`	拟南芥	N(6)-adenosine-methyltransferase MT-A70-like	62.020%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q6EU10`	水稻	Probable N(6)-adenosine-methyltransferase MT-A70-like	59.654%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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