基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_025449
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 111948219-111953733
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2175 bp · LXL04_025449|LXL04_025449|OH1004|cDNA
ATGCGCTTCAAAGAAACCATTCTGTTCCTTATATGTTTCTCTCTATCCATAACCATCTCATCTGGAGCCAACACCATATCTGCAAACCAGTCTTTGTCTGGAGACCAAACCATCATATCCGAAGGTGAACAATTCGAGCTGGGTTTTTTCAAAGCAGGTAACACTTCCAATTATTACATAGGCATTTGGTATAATAAGCTCAATTCCAATCCTCCTACCATTGTTTGGGTGGCAAACAGAGAAACACCCATCTCCGATAG...
CDS
下载 CDS FASTA2175 bp · LXL04_025449|LXL04_025449|OH1004|CDS
ATGCGCTTCAAAGAAACCATTCTGTTCCTTATATGTTTCTCTCTATCCATAACCATCTCATCTGGAGCCAACACCATATCTGCAAACCAGTCTTTGTCTGGAGACCAAACCATCATATCCGAAGGTGAACAATTCGAGCTGGGTTTTTTCAAAGCAGGTAACACTTCCAATTATTACATAGGCATTTGGTATAATAAGCTCAATTCCAATCCTCCTACCATTGTTTGGGTGGCAAACAGAGAAACACCCATCTCCGATAG...
724 aa · LXL04_025449|LXL04_025449|OH1004|PROTEIN
MRFKETILFLICFSLSITISSGANTISANQSLSGDQTIISEGEQFELGFFKAGNTSNYYIGIWYNKLNSNPPTIVWVANRETPISDRFRSELKIINGNLVLLNESKSQIWSTNVIATTTTLKSAEALILDNGNLVLRDGSNSVEPVWQSFDNPTHTWLPGMFSVELRPSSKEYVIKWNGSQQYWTTGNWNGKSFDLIPQLSLTHNYDFRQFGLTSCHCLTGFKPRSENDWNQSDFSVKNMPPNNSVAIGNAGECRTTCLN...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_025449 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_025449 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:111948219-111953733 (+) |
| 描述 | Similar to SD22: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0048544 recognition of pollen 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005516 calmodulin binding 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能 GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能 GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G19130 ath:AT4G00340 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.767
内质网0.116
细胞质0.081
细胞核0.059
细胞外0.045
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01453.31B_lectin73-163 aaPF08276.18PAN_2247-283 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr367-443 aaPF00069.32Pkinase368-447 aaPF04844.19Ovate585-635 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_025449 | PF01453.31 | B_lectin | 73 | 163 | 2.2e-26 | 93.1 |
| LXL04_025449 | PF08276.18 | PAN_2 | 247 | 283 | 2.3e-09 | 37.9 |
| LXL04_025449 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 367 | 443 | 4.2e-10 | 40.1 |
| LXL04_025449 | PF00069.32 | Pkinase | 368 | 447 | 7.9e-09 | 36.0 |
| LXL04_025449 | PF04844.19 | Ovate | 585 | 635 | 8.6e-22 | 77.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q39203 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2 | 32.197% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O64477 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 | 42.149% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SXB5 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g11303 | 26.058% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
O64781 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61390 | 25.383% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
O64774 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61460 | 27.154% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |