LXL04_024975 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_024975

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 103205110-103209316 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

759 bp · LXL04_024975|LXL04_024975|OH1004|cDNA

ATGAAGAGTGAACAAGAGTCCAAAGGCAAGAAGTACGAAACTTGGTTTAAACTCAAGGAATGCATGAGCAACCCGCTCGACCTAAACAACTTACCAGAGGATATCGCCAGAGATCATGACAAACAACTCCTTGATGACTCCTCTCCTTCTGCAGGAAGCTACAGAAAAAAGAAAAACGGCGCAAAGGATGAATGTAGGAAGGTCTATGAGTGTAGGTTTTGCTCCCTTAAATTCTGCAAATCTCAAGCCCTTGGGGGACA...

CDS

下载 CDS FASTA

759 bp · LXL04_024975|LXL04_024975|OH1004|CDS

ATGAAGAGTGAACAAGAGTCCAAAGGCAAGAAGTACGAAACTTGGTTTAAACTCAAGGAATGCATGAGCAACCCGCTCGACCTAAACAACTTACCAGAGGATATCGCCAGAGATCATGACAAACAACTCCTTGATGACTCCTCTCCTTCTGCAGGAAGCTACAGAAAAAAGAAAAACGGCGCAAAGGATGAATGTAGGAAGGTCTATGAGTGTAGGTTTTGCTCCCTTAAATTCTGCAAATCTCAAGCCCTTGGGGGACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

252 aa · LXL04_024975|LXL04_024975|OH1004|PROTEIN

MKSEQESKGKKYETWFKLKECMSNPLDLNNLPEDIARDHDKQLLDDSSPSAGSYRKKKNGAKDECRKVYECRFCSLKFCKSQALGGHMNRHRQERENETLYRARQLVFGNDNLYQRGSQPTVHGGYHPQPSPAGSNMQGNTLYPTRLFSGASTAVLPPVLPPHQHLYTSPPSRLSNPYSSQHSKSESGKDYFMGHVCSNNSQFIFQNLRPPPDGTNNYTCIGAPVGQTFTVTGGSGGDMSASPINRYHEDGY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_024975`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_024975

位置 Chr05:103205110-103209316 (+)

描述 Similar to SL1: Zinc finger protein STAMENLESS 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g68480`	控制侧生器官的形态发生。	暂无已核实直接文献
`At1g13400`	与 JAG 一起促进雄蕊和心皮的生长及模式形成。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0129200`	调节花器官的身份和内花轮细胞增殖。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024975 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程

GO:0009908 flower development 生物过程

GO:0009909 regulation of flower development 生物过程

GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程

GO:0010093 specification of floral organ identity 生物过程

GO:0010094 specification of carpel identity 生物过程

GO:0010097 specification of stamen identity 生物过程

GO:0010158 abaxial cell fate specification 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0048437 floral organ development 生物过程

GO:0048440 carpel development 生物过程

GO:0048443 stamen development 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G13400

ath:AT1G68480

dosa:Os01g0129000

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.968

排名 1 · LXL04_024975 · OH-1004

细胞质0.097

排名 2 · LXL04_024975 · OH-1004

细胞膜0.029

排名 3 · LXL04_024975 · OH-1004

内质网0.017

排名 4 · LXL04_024975 · OH-1004

质体0.010

排名 5 · LXL04_024975 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6S591`	拟南芥	Zinc finger protein JAGGED	61.538%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q6S592`	拟南芥	Zinc finger protein JAGGED-like	39.423%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LG97`	水稻	Zinc finger protein STAMENLESS 1	40.969%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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