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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024931
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 102364106-102365851 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1041 bp · LXL04_024931|LXL04_024931|OH1004|cDNA

ATGCCCTCTACGATCTCCCAACCTCAATCACCACTTCACCTAAATCAGATTCAGAATCTGTTGGGATCAGGTGGGTTTGGTTATGTGTATAAGGGGTGTTTGGTTGATGGGACAGAAGTAGCAGTAAAAGAGCTTAAAATTGGAGGAGGGCAAGGGGAACGCGAGTTCAGTGCTGAGGTGGAAATTATCAGCAGAATTCATCATCGTTATTTGGTGTCACTTGTTGGTTATTGTGTATCCGAGAACAAAAGGCTGCTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1041 bp · LXL04_024931|LXL04_024931|OH1004|CDS

ATGCCCTCTACGATCTCCCAACCTCAATCACCACTTCACCTAAATCAGATTCAGAATCTGTTGGGATCAGGTGGGTTTGGTTATGTGTATAAGGGGTGTTTGGTTGATGGGACAGAAGTAGCAGTAAAAGAGCTTAAAATTGGAGGAGGGCAAGGGGAACGCGAGTTCAGTGCTGAGGTGGAAATTATCAGCAGAATTCATCATCGTTATTTGGTGTCACTTGTTGGTTATTGTGTATCCGAGAACAAAAGGCTGCTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

346 aa · LXL04_024931|LXL04_024931|OH1004|PROTEIN

MPSTISQPQSPLHLNQIQNLLGSGGFGYVYKGCLVDGTEVAVKELKIGGGQGEREFSAEVEIISRIHHRYLVSLVGYCVSENKRLLVYEYVPNNTLYFHLHGSEVVLDWSTRVKVASGAARGIAYLHEDCHPRIIHRDIKSSNILLDKNFEARVSDFGLAKLAADFSTHVTTRVMGTFGYMAPEYASSGKLTEKSDVYSFGVVLLELITGRKPVDASQPLGDESLVEWARPLLSHALETEDFKVLVDPKLGTNFIASEMF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024931
TK1151 IDTkA06G095180
OH-1004 IDLXL04_024931
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 45.897 / OH-1004 95.376
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024931
位置Chr05:102364106-102365851 (+)
描述Similar to PERK9: Proline-rich receptor-like protein kinase PERK9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68690 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At1g26150 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At5g38560 可能参与根生长的负调控。
PERK-KIPK-KCBP signalling negatively regulates root growth in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1093/jxb/eru390
At1g70460 负向调控根毛伸长。 暂无已核实直接文献
At1g23540 在枝条分枝过程中调节生长素相关的 MAX（更多侧枝生长）途径。
Over-expression of the IGI1 leading to altered shoot-branching development related to MAX pathway in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1007/s11103-010-9645-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024931 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0032502 developmental process 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1990641 response to iron ion starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23540
ath:AT1G26150
ath:AT1G68690
ath:AT1G70460
ath:AT5G38560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.519
排名 1 · LXL04_024931 · OH-1004
细胞质0.389
排名 2 · LXL04_024931 · OH-1004
细胞核0.260
排名 3 · LXL04_024931 · OH-1004
高尔基体0.043
排名 4 · LXL04_024931 · OH-1004
内质网0.040
排名 5 · LXL04_024931 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr17-285 aa
PF00069.32Pkinase18-219 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024931PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr172859.6e-47160.2
LXL04_024931PF00069.32Pkinase182195.1e-44151.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SX31拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK980.062%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9C660拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1079.503%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FFW5拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK874.455%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9CAL8拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1365.046%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9ZUE0拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1265.495%Swiss-Prot强数据库同源证据

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