基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_024867
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 101061791-101063159
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA588 bp · LXL04_024867|LXL04_024867|OH1004|cDNA
ATGGGCTTGTGGGATTCTTTACTCAATTGGCTTCGCAGTGCTTTACGATTCTTACCATGTTTAGATATCAGTTTGTTCTTTAAACAGGAAATGGAGCTTTCCCTAGTAGGCCTTCAAGATGCTGGAAAGACATCTCTCGTGAATTCCATTGCTACAGGCGGCTATAGCGAGGACATGATTCCAACTGTTGGATTTAATATGCGAAAAGTCACTAAAGGAAATGTCACAATTAAGCTTTGGGATCTTGGAGGACAACGGAG...
CDS
下载 CDS FASTA588 bp · LXL04_024867|LXL04_024867|OH1004|CDS
ATGGGCTTGTGGGATTCTTTACTCAATTGGCTTCGCAGTGCTTTACGATTCTTACCATGTTTAGATATCAGTTTGTTCTTTAAACAGGAAATGGAGCTTTCCCTAGTAGGCCTTCAAGATGCTGGAAAGACATCTCTCGTGAATTCCATTGCTACAGGCGGCTATAGCGAGGACATGATTCCAACTGTTGGATTTAATATGCGAAAAGTCACTAAAGGAAATGTCACAATTAAGCTTTGGGATCTTGGAGGACAACGGAG...
195 aa · LXL04_024867|LXL04_024867|OH1004|PROTEIN
MGLWDSLLNWLRSALRFLPCLDISLFFKQEMELSLVGLQDAGKTSLVNSIATGGYSEDMIPTVGFNMRKVTKGNVTIKLWDLGGQRRFRTMWERYCRGVTAILYVVDAADRDSIPITKTELHDLLTKPSLNGIPLLVLGNKIDKSQALTKQALVDQLGLDTITDREVCCYMISCKESINIDMVIDWLIKHSKTAT
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_024867 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA06G099450 |
| OH-1004 ID | LXL04_024867 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Probable |
| 蛋白一致性 (%) | 93.800 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_024867 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:101061791-101063159 (-) |
| 描述 | Similar to ARL8C: ADP-ribosylation factor-like protein 8c |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002505 antigen processing and presentation of polysaccharide antigen via MHC class II 生物过程 GO:0002747 antigen processing and presentation following phagocytosis 生物过程 GO:0007059 chromosome segregation 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0016197 endosomal transport 生物过程 GO:0032418 lysosome localization 生物过程 GO:0034058 endosomal vesicle fusion 生物过程 GO:0034498 early endosome to Golgi transport 生物过程 GO:0046754 viral exocytosis 生物过程 GO:0051301 cell division 生物过程 GO:0051607 defense response to virus 生物过程 GO:0061909 autophagosome-lysosome fusion 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G49870 ath:AT5G37680 ath:AT5G67560 mmu:67166 rno:500282 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.322
高尔基体0.301
内质网0.272
细胞膜0.172
溶酶体／液泡0.140
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00025.28Arf28-189 aaPF09439.17SRPRB33-157 aaPF00071.29Ras34-190 aaPF08477.20Roc34-143 aaPF01926.30MMR_HSR134-141 aaPF04670.19Gtr1_RagA35-156 aaPF00503.27G-alpha60-113 aaPF00009.34GTP_EFTU66-191 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_024867 | PF00025.28 | Arf | 28 | 189 | 2.6e-43 | 148.2 |
| LXL04_024867 | PF09439.17 | SRPRB | 33 | 157 | 6.3e-08 | 32.9 |
| LXL04_024867 | PF00071.29 | Ras | 34 | 190 | 1.7e-18 | 67.4 |
| LXL04_024867 | PF08477.20 | Roc | 34 | 143 | 7.4e-16 | 59.2 |
| LXL04_024867 | PF01926.30 | MMR_HSR1 | 34 | 141 | 3.4e-06 | 27.9 |
| LXL04_024867 | PF04670.19 | Gtr1_RagA | 35 | 156 | 2.8e-08 | 34.2 |
| LXL04_024867 | PF00503.27 | G-alpha | 60 | 113 | 7.8e-08 | 32.5 |
| LXL04_024867 | PF00009.34 | GTP_EFTU | 66 | 191 | 1.1e-06 | 29.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。