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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024110
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 81271037-81272023 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

987 bp · LXL04_024110|LXL04_024110|OH1004|cDNA

ATGGAGACAACCCAACCTACTCTTCCCAAGGACTTGCAGAATTCTCAAGTGTCTCAAGAGTTCAAGGATCTGACTTCCAGTTTGCCCAAAAACAGAGGGTGGGTTGTACCCGTCGTACACCAATACCAAGGTTTCTGGCATTATGATTGGCAACTCCAAGGAGTTCTCTCATATCAAAAACATTTTCAAGCACAAGACACCGATATCCTACTTGTTACCACACCAAAATCTGGCACCACCTGGTTAAAAGCAATCTCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

987 bp · LXL04_024110|LXL04_024110|OH1004|CDS

ATGGAGACAACCCAACCTACTCTTCCCAAGGACTTGCAGAATTCTCAAGTGTCTCAAGAGTTCAAGGATCTGACTTCCAGTTTGCCCAAAAACAGAGGGTGGGTTGTACCCGTCGTACACCAATACCAAGGTTTCTGGCATTATGATTGGCAACTCCAAGGAGTTCTCTCATATCAAAAACATTTTCAAGCACAAGACACCGATATCCTACTTGTTACCACACCAAAATCTGGCACCACCTGGTTAAAAGCAATCTCTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

328 aa · LXL04_024110|LXL04_024110|OH1004|PROTEIN

METTQPTLPKDLQNSQVSQEFKDLTSSLPKNRGWVVPVVHQYQGFWHYDWQLQGVLSYQKHFQAQDTDILLVTTPKSGTTWLKAISFAITNRIQYHVASRDHPLIKNNPHVLVPFVEYVYADNPIPDFSAIPSPRLFATHVPYVSLPDSVHNSNCKLVYMCRNPKDLFVSLFHFANKLRPQHMGANSMEEVFELFCEGVSVYGPYWEHVLGFWNESLRRPKEVLFLKYEDMKAQPGIQVRKLAEFYGCPFTAEEEKEGIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024110
TK1151 IDTkA06G177690
OH-1004 IDLXL04_024110
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)67.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024110
位置Chr05:81271037-81272023 (+)
描述Similar to SOT12: Cytosolic sulfotransferase 12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g03760 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 作为磺酸盐供体来催化 24-表油菜素甾醇的立体特异性硫酸盐缀合。
Molecular and biochemical characterization of two brassinosteroid sulfotransferases from Arabidopsis, AtST4a (At2g14920) and AtST1 (At2g03760).2007 · DOI: 10.1007/s00425-006-0413-y
A stress-inducible sulphotransferase sulphonates salicylic acid and confers pathogen resistance in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2010.02156.x
At3g45070 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 作为磺酸盐供体，特异性催化黄酮和黄酮醇的硫酸盐缀合。
Biochemical and molecular characterization of flavonoid 7-sulfotransferase from Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2006.10.004
At2g03770 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。 暂无已核实直接文献
At5g07010 磺基转移酶，利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 作为磺酸盐供体，特异性催化羟基茉莉酮酸酯的硫酸盐缀合，优先选择 12-羟基茉莉酮酸酯而不是 11-羟基茉莉酮酸酯。
Biochemical and molecular characterization of a hydroxyjasmonate sulfotransferase from Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m211943200
At3g45080 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024110 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009806 lignan metabolic process 生物过程
GO:0009812 flavonoid metabolic process 生物过程
GO:0016131 brassinosteroid metabolic process 生物过程
GO:0051923 sulfation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G03760
ath:AT2G03770
ath:AT3G45070
ath:AT3G45080
ath:AT5G07010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.852
排名 1 · LXL04_024110 · OH-1004
细胞核0.206
排名 2 · LXL04_024110 · OH-1004
内质网0.053
排名 3 · LXL04_024110 · OH-1004
过氧化物酶体0.041
排名 4 · LXL04_024110 · OH-1004
线粒体0.034
排名 5 · LXL04_024110 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00685.34Sulfotransfer_166-325 aa
PF13469.13Sulfotransfer_3154-251 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024110PF00685.34Sulfotransfer_1663253e-79266.8
LXL04_024110PF13469.13Sulfotransfer_31542514.6e-0731.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P52839拟南芥Cytosolic sulfotransferase 1251.070%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9M1V2拟南芥Cytosolic sulfotransferase 549.689%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZPQ5拟南芥Cytosolic sulfotransferase 1348.476%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8L5A7拟南芥Cytosolic sulfotransferase 1545.370%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M1V1拟南芥Cytosolic sulfotransferase 648.598%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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