LXL04_023182 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_023182

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 25935259-25937934 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

963 bp · LXL04_023182|LXL04_023182|OH1004|cDNA

ATGATCGTATCGGAACACATTCCAAGACATCGGACTTTAATGGCGACCATCTCCTCAATTGAAAACAGCAAGCTCACCCGTATTCTTCAACCTGCACTTGGTAATGCAAAAATTTCCATCATTTGTACTGTGGCACCAAAAGAGGTTCATGTAGAAGAAACAAAGGGTACCCTTCAGTTTATCCGTAGAGCTAAACGTATCACCAACTATGTTCAAGTAAACGAGGGATCTCATGCGGGGGGTGCTGGAGCAAGAAATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

963 bp · LXL04_023182|LXL04_023182|OH1004|CDS

ATGATCGTATCGGAACACATTCCAAGACATCGGACTTTAATGGCGACCATCTCCTCAATTGAAAACAGCAAGCTCACCCGTATTCTTCAACCTGCACTTGGTAATGCAAAAATTTCCATCATTTGTACTGTGGCACCAAAAGAGGTTCATGTAGAAGAAACAAAGGGTACCCTTCAGTTTATCCGTAGAGCTAAACGTATCACCAACTATGTTCAAGTAAACGAGGGATCTCATGCGGGGGGTGCTGGAGCAAGAAATCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

320 aa · LXL04_023182|LXL04_023182|OH1004|PROTEIN

MIVSEHIPRHRTLMATISSIENSKLTRILQPALGNAKISIICTVAPKEVHVEETKGTLQFIRRAKRITNYVQVNEGSHAGGAGARNLELRNDMLKHGLEHEKLDMELEEERKSHIEQEQCSREHQMKNGSSDSEGISTRETMSKKIQVIVSIPQLLNQLQILLLLKDLINLGHLCIPGHFKMNLDCSIDNHKEVENLRMQLQQAIDERNEFESFEEDDDKSPTSKLISTTNEVVKSIMSTLEAEVSVAINGYRKRDNLED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_023182`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_023182

位置 Chr05:25935259-25937934 (+)

描述 Similar to KIN7N: Kinesin-like protein KIN-7N

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g59540`	类动力蛋白 KIN-7N。	暂无已核实直接文献
`UniProt: F4J2K4`	类驱动蛋白 KIN-7O。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os11g0552600`	驱动蛋白样蛋白KIN-7L。	暂无已核实直接文献
`Os09g0421200`	类动力蛋白 KIN-7I。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023182 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore 生物过程

GO:0033044 regulation of chromosome organization 生物过程

GO:0042327 positive regulation of phosphorylation 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0090307 mitotic spindle assembly 生物过程

GO:0140694 membraneless organelle assembly 生物过程

GO:1901987 regulation of cell cycle phase transition 生物过程

GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分

GO:0000776 kinetochore 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G59540

ath:AT3G10180

ddi:DDB_G0285101

dosa:Os09g0421200

dosa:Os11g0552600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.511

排名 1 · LXL04_023182 · OH-1004

细胞核0.383

排名 2 · LXL04_023182 · OH-1004

细胞膜0.089

排名 3 · LXL04_023182 · OH-1004

线粒体0.066

排名 4 · LXL04_023182 · OH-1004

高尔基体0.052

排名 5 · LXL04_023182 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00225.30Kinesin21-67 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_023182	`PF00225.30`	Kinesin	21	67	1.7e-09	37.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9S7P3`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7N	52.308%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`F4J2K4`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7O	40.441%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q2R2P7`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7L	51.304%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`B9G3M6`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7I	60.000%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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