基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_022123
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 145021602-145027786
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4320 bp · LXL04_022123|LXL04_022123|OH1004|cDNA
ATGGCGGCATCACATACTGGAGATGACGTGGCGAGGTCACAGTTGAGTTTATCGGCATCAAGTAGGAACTGGGCTTCAGCTAGCCTCAGAGATGCTTTCTCTGGAGCACCTGGAGGCGATGCTTTTGAGAAAATTGGGATgcaagatgatgaagatgaactCAAATTGGCTGCAATTGAGAGGCTTCCTACTTATGAAGGATCAAAGAAAGAAATGTTGAAGCAAGTTCCTGATAATGGAAGAACCCACACTACAAATAC...
CDS
下载 CDS FASTA4320 bp · LXL04_022123|LXL04_022123|OH1004|CDS
ATGGCGGCATCACATACTGGAGATGACGTGGCGAGGTCACAGTTGAGTTTATCGGCATCAAGTAGGAACTGGGCTTCAGCTAGCCTCAGAGATGCTTTCTCTGGAGCACCTGGAGGCGATGCTTTTGAGAAAATTGGGATGCAAGATGATGAAGATGAACTCAAATTGGCTGCAATTGAGAGGCTTCCTACTTATGAAGGATCAAAGAAAGAAATGTTGAAGCAAGTTCCTGATAATGGAAGAACCCACACTACAAATAC...
1439 aa · LXL04_022123|LXL04_022123|OH1004|PROTEIN
MAASHTGDDVARSQLSLSASSRNWASASLRDAFSGAPGGDAFEKIGMQDDEDELKLAAIERLPTYEGSKKEMLKQVPDNGRTHTTNTGPLDKKQLMENVLKLVEEDNETFLRCLRERTDRVGIEIPKIEVRYKNLSIEGNVFIGSRALPTLFNATLNAIEGFLQVLRIVPSNKQVLKILQDVSGILRPSRMTLLLGPPSAGKTTFLKTLAGVPVKDLTITGEVTYCGHKMSEFIPQRTCAYISQHDVHHGEMTVRETFDF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_022123 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_022123 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:145021602-145027786 (-) | |||||||||
| 描述 | Similar to PDR2: Pleiotropic drug resistance protein 2 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程 GO:0009617 response to bacterium 生物过程 GO:0009914 hormone transport 生物过程 GO:0015691 cadmium ion transport 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0042908 xenobiotic transport 生物过程 GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程 GO:0098657 import into cell 生物过程 GO:2000032 regulation of secondary shoot formation 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0005524 ATP binding 分子功能 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G66950 ath:AT2G36380 dosa:Os07g0522500 dosa:Os11g0587600 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.663
内质网0.164
细胞质0.119
溶酶体／液泡0.092
高尔基体0.077
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14510.12ABC_trans_N104-154 aaPF00005.34ABC_tran179-360 aaPF19055.7ABC2_membrane_7394-445 aaPF01061.30ABC2_membrane516-727 aaPF08370.17PDR_assoc732-798 aaPF00005.34ABC_tran866-1018 aaPF19055.7ABC2_membrane_71047-1078 aaPF01061.30ABC2_membrane1163-1376 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_022123 | PF14510.12 | ABC_trans_N | 104 | 154 | 7.3e-08 | 33.4 |
| LXL04_022123 | PF00005.34 | ABC_tran | 179 | 360 | 2e-37 | 129.6 |
| LXL04_022123 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 394 | 445 | 1.6e-15 | 57.7 |
| LXL04_022123 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 516 | 727 | 1e-102 | 342.9 |
| LXL04_022123 | PF08370.17 | PDR_assoc | 732 | 798 | 1.7e-21 | 76.4 |
| LXL04_022123 | PF00005.34 | ABC_tran | 866 | 1018 | 2e-37 | 129.6 |
| LXL04_022123 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 1047 | 1078 | 1.6e-15 | 57.7 |
| LXL04_022123 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 1163 | 1376 | 1e-102 | 342.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。