LXL04_021372 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_021372

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 128368347-128368949 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

516 bp · LXL04_021372|LXL04_021372|OH1004|cDNA

ATGCGGAAATCTCGGAGCTTTTTCAAGTTCATTCCCATGGTTTCTAGGGCTGCGTTTGTGATATCGGAGACGTATACTGCTATATACTCTAAATCCAGACATCCTTGTGCTATTGCTAATCCCCTTTGTGAAACAACACCCTCTTCGTCTTCCATTTCCTGTTCATCTGCTCCTCGCTCGATTCGAAGCCGTTTCAGCAATTTCATCAAATTTGGTTGGATGTTTACGGAATTATCGTTCTCTGTTTCTTTTCAGTTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

516 bp · LXL04_021372|LXL04_021372|OH1004|CDS

ATGCGGAAATCTCGGAGCTTTTTCAAGTTCATTCCCATGGTTTCTAGGGCTGCGTTTGTGATATCGGAGACGTATACTGCTATATACTCTAAATCCAGACATCCTTGTGCTATTGCTAATCCCCTTTGTGAAACAACACCCTCTTCGTCTTCCATTTCCTGTTCATCTGCTCCTCGCTCGATTCGAAGCCGTTTCAGCAATTTCATCAAATTTGGTTGGATGTTTACGGAATTATCGTTCTCTGTTTCTTTTCAGTTCTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

171 aa · LXL04_021372|LXL04_021372|OH1004|PROTEIN

MRKSRSFFKFIPMVSRAAFVISETYTAIYSKSRHPCAIANPLCETTPSSSSISCSSAPRSIRSRFSNFIKFGWMFTELSFSVSFQFSNSSVQELTRAVMEKKGVPDIIVNNAGTINKNNRLWEVPEEEFNAVIDTNLKGVANILCHFIPLMIENFHSPVSNHVSCLQFHQI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_021372`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_021372

位置 Chr04:128368347-128368949 (+)

描述 Similar to At1g10310: NADPH-dependent pterin aldehyde reductase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g10310`	NADPH依赖的蝶呤醛还原酶，参与叶酸代谢过程中蝶呤醛的回收。	Folate salvage in plants: pterin aldehyde reduction is mediated by multiple non-specific aldehyde reductases.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03143.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021372 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006760 folic acid-containing compound metabolic process 生物过程

GO:0030497 fatty acid elongation 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004316 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity 分子功能

GO:0016616 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

GO:0051287 NAD binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G10310

sam:MW1114

sep:SE_0906

ser:SERP0797

tma:TM1724

tmi:THEMA_05620

tmm:Tmari_1732

tmw:THMA_1766

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.407

排名 1 · LXL04_021372 · OH-1004

细胞质0.308

排名 2 · LXL04_021372 · OH-1004

细胞核0.194

排名 3 · LXL04_021372 · OH-1004

质体0.076

排名 4 · LXL04_021372 · OH-1004

过氧化物酶体0.058

排名 5 · LXL04_021372 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00106.32adh_short87-154 aa

PF13561.13adh_short_C288-154 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_021372	`PF00106.32`	adh_short	87	154	3.5e-09	37.1
LXL04_021372	`PF13561.13`	adh_short_C2	88	154	1.7e-09	38.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SY73`	拟南芥	NADPH-dependent pterin aldehyde reductase	69.697%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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