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基因概览

LXL04_018879

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 19526844-19528065 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

441 bp · LXL04_018879|LXL04_018879|OH1004|cDNA

ATGAAAATCGAATTGTATTTTGCAACTTGGTGGTCTTTGAATGTGGtgtttaatatttataataagAAGGTTTTGAATGCTTTTTCGTTTCCATGGCTAACATCAACTCTTTCTTTGGCTGTTGGATCTTTGATTATGTTGGTTTCATGGGTTACTAAGATGGTTGAAGCTCCGAAGACCGATGTTGAATTTTGGAAAACTCTGTTTCCGGTGGCATTAGCACATACAATTGAACACGCGGCAGCTACAACCAGTATGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

441 bp · LXL04_018879|LXL04_018879|OH1004|CDS

ATGAAAATCGAATTGTATTTTGCAACTTGGTGGTCTTTGAATGTGGTGTTTAATATTTATAATAAGAAGGTTTTGAATGCTTTTTCGTTTCCATGGCTAACATCAACTCTTTCTTTGGCTGTTGGATCTTTGATTATGTTGGTTTCATGGGTTACTAAGATGGTTGAAGCTCCGAAGACCGATGTTGAATTTTGGAAAACTCTGTTTCCGGTGGCATTAGCACATACAATTGAACACGCGGCAGCTACAACCAGTATGTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

146 aa · LXL04_018879|LXL04_018879|OH1004|PROTEIN

MKIELYFATWWSLNVVFNIYNKKVLNAFSFPWLTSTLSLAVGSLIMLVSWVTKMVEAPKTDVEFWKTLFPVALAHTIEHAAATTSMSKVAGSFTHIIKSTEPAFSVLVSRFFLSETFLIGVYLSLLPIIGGCGPSAFTELNFNMTG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018879`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018879

位置 Chr04:19526844-19528065 (+)

描述 Similar to GPT2: Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 2, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g61800`	6-磷酸葡萄糖转运蛋白。	The Arabidopsis plastidic glucose 6-phosphate/phosphate translocator GPT1 is essential for pollen maturation and embryo sac development.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.029124 Dynamic acclimation of photosynthesis increases plant fitness in changing environments.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.149351 The role of plastidial glucose-6-phosphate/phosphate translocators in vegetative tissues of Arabidopsis thaliana mutants impaired in starch biosynthesis.2010 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2010.00349.x GPT2: a glucose 6-phosphate/phosphate translocator with a novel role in the regulation of sugar signalling during seedling development.2014 · DOI: 10.1093/aob/mct298 Acclimation of metabolism to light in Arabidopsis thaliana: the glucose 6-phosphate/phosphate translocator GPT2 directs metabolic acclimation.2015 · DOI: 10.1111/pce.12495
`At5g54800`	6-磷酸葡萄糖转运蛋白。	The Arabidopsis plastidic glucose 6-phosphate/phosphate translocator GPT1 is essential for pollen maturation and embryo sac development.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.029124 The plastidial glucose-6-phosphate/phosphate antiporter GPT1 is essential for morphogenesis in Arabidopsis embryos.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04313.x The Arabidopsis Plastidial Glucose-6-Phosphate Transporter GPT1 is Dually Targeted to Peroxisomes via the Endoplasmic Reticulum.2020 · DOI: 10.1105/tpc.19.00959
`At5g17630`	糖磷酸/磷酸转运蛋白，运输无机磷酸、三碳磷酸盐、3-磷酸甘油酸、木酮糖 5-磷酸（Xul-5-P），以及在较小程度上运输核酮糖 5-磷酸。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0172100`	磷酸烯醇丙酮酸/磷酸转运蛋白，运输磷酸烯醇丙酮酸（PEP）和二羟基丙酮磷酸。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018879 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007033 vacuole organization 生物过程

GO:0009553 embryo sac development 生物过程

GO:0009624 response to nematode 生物过程

GO:0009643 photosynthetic acclimation 生物过程

GO:0009744 response to sucrose 生物过程

GO:0009749 response to glucose 生物过程

GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程

GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程

GO:0010152 pollen maturation 生物过程

GO:0015713 phosphoglycerate transmembrane transport 生物过程

GO:0015714 phosphoenolpyruvate transport 生物过程

GO:0015760 glucose-6-phosphate transport 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G61800

ath:AT5G17630

ath:AT5G54800

dosa:Os01g0172100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.467

排名 1 · LXL04_018879 · OH-1004

高尔基体0.271

排名 2 · LXL04_018879 · OH-1004

质体0.062

排名 3 · LXL04_018879 · OH-1004

溶酶体／液泡0.056

排名 4 · LXL04_018879 · OH-1004

细胞质0.051

排名 5 · LXL04_018879 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03151.23TPT1-146 aa

PF00892.27EamA19-132 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018879	`PF03151.23`	TPT	1	146	7.2e-51	174.0
LXL04_018879	`PF00892.27`	EamA	19	132	3.1e-06	28.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q94B38`	拟南芥	Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 2, chloroplastic	79.452%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9M5A9`	拟南芥	Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 1, chloroplastic	77.397%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9LF61`	拟南芥	Xylulose 5-phosphate/phosphate translocator, chloroplastic	46.575%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q5VQL3`	水稻	Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 3, chloroplastic	43.066%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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