LXL04_018383 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_018383

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 12307913-12309711 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1080 bp · LXL04_018383|LXL04_018383|OH1004|cDNA

ATGATGCTGTGCTGTGGATCTTGTCGTAGGAAGAAAGAGAACCAGAATACTAATGATGGTGCAACCACGAACAATTGTCAAACAGCACCACCTCGCGGACCCCTTTATGCCGGAGGCAGCATGAGAGCACCAAGAACCAATGGACCTGGGGCCAAGAAAGATTCACCAATCGAAGCACCATCTTTAACATTCGAAGAACTAAACAAAATGACGGATAATTTCGGTTCAAAATCTTTAATTGGTGAAGGCTCTTACAGCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1080 bp · LXL04_018383|LXL04_018383|OH1004|CDS

ATGATGCTGTGCTGTGGATCTTGTCGTAGGAAGAAAGAGAACCAGAATACTAATGATGGTGCAACCACGAACAATTGTCAAACAGCACCACCTCGCGGACCCCTTTATGCCGGAGGCAGCATGAGAGCACCAAGAACCAATGGACCTGGGGCCAAGAAAGATTCACCAATCGAAGCACCATCTTTAACATTCGAAGAACTAAACAAAATGACGGATAATTTCGGTTCAAAATCTTTAATTGGTGAAGGCTCTTACAGCCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

359 aa · LXL04_018383|LXL04_018383|OH1004|PROTEIN

MMLCCGSCRRKKENQNTNDGATTNNCQTAPPRGPLYAGGSMRAPRTNGPGAKKDSPIEAPSLTFEELNKMTDNFGSKSLIGEGSYSRIFYGKLEDGEEVAIKKLDTTSSTEPLSEFKEKLSTISRLKSEYFCELRGYCLENHNRILLYQYANKGCLHEVLHGGKGGVELNWVQRVRIAYGAAKGLEYLHEKVQPPIVHRDIRSSNVLVFDDFHSKISDFSLCNMLSENPARMHSTRVLGTFGYHAPEYAMTGQITNKSDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018383`
TK1151 ID	TkA08G057970
OH-1004 ID	LXL04_018383
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018383

位置 Chr04:12307913-12309711 (-)

描述 Similar to At2g41970: Probable protein kinase At2g41970

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g41970`	可能通过磷酸化脱落酸受体，参与脱水条件下的脱落酸信号转导。	Monomerization of abscisic acid receptors through CARKs-mediated phosphorylation.2022 · DOI: 10.1111/nph.18149
`At2g43230`	类受体胞质激酶（RLCK），通过磷酸化并激活ABA受体以支持其单体化并增强其ABA结合能力，从而触发脱水响应的脱落酸（ABA）信号；它们反过来抑制作为ABA反应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶。	CARK6 is involved in abscisic acid to regulate stress responses in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.03.180 Catalytically inactive subgroup VIII receptor-like cytoplasmic kinases regulate the immune-triggered oxidative burst in Arabidopsis thaliana.2025 · DOI: 10.1093/jxb/erae486
`At2g30740`	类受体胞质激酶（RLCK），通过磷酸化并激活ABA受体以支持其单体化并增强其ABA结合亲和力，从而在脱水响应中触发脱落酸（ABA）信号；反过来，它们抑制作为ABA反应负调控因子的PP2C蛋白磷酸酶（按相似性）。	暂无已核实直接文献
`At3g59350`	类受体的胞质激酶 (RLCK)，通过磷酸化和激活 ABA 受体（如 PYL8/RCAR3、PYR1/RCAR11、PYL1/RCAR12、PYL3/RCAR13 和 PYL2/RCAR14）来触发脱水响应的脱落酸 (ABA) 信号传导，以支持其单体化并增强 ABA 结合亲和力；这些受体反过来抑制作为 ABA 反应负调控因子的 PP2C 蛋白磷酸酶。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018383 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009860 pollen tube growth 生物过程

GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程

GO:0010375 stomatal complex patterning 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程

GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程

GO:1901653 cellular response to peptide 生物过程

GO:2000037 regulation of stomatal complex patterning 生物过程

GO:2000038 regulation of stomatal complex development 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G30740

ath:AT2G41970

ath:AT3G59350

sly:544006

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.729

排名 1 · LXL04_018383 · OH-1004

细胞质0.233

排名 2 · LXL04_018383 · OH-1004

细胞核0.204

排名 3 · LXL04_018383 · OH-1004

内质网0.036

排名 4 · LXL04_018383 · OH-1004

高尔基体0.026

排名 5 · LXL04_018383 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase77-339 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr78-346 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018383	`PF00069.32`	Pkinase	77	339	3.2e-35	122.5
LXL04_018383	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	78	346	1e-44	153.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P93749`	拟南芥	Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 4	67.292%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9ZW72`	拟南芥	Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 6	61.202%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O49339`	拟南芥	Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 8	66.343%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`B9DFG5`	拟南芥	Protein CYTOSOLIC ABA RECEPTOR KINASE 5	66.254%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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