LXL04_018020 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_018020

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 5180307-5184219 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2196 bp · LXL04_018020|LXL04_018020|OH1004|cDNA

ATGCAATCTGAATCCGTGGAAACATCGCTGTTTGATTTGTTGACCGCAGCTCTCAAGGGGAAACTTATAGGCAGTGTTAACGGATCGGATAGCGGAGACTCAACGATGCCGCTGGCTTTGGCGACGATTTTGGAAAATCGTGAGCTCTTGGTGATACTGACAACGTCAGTTGCTGTTTTGGTAGGATGTTTTGTTGTTCTGGTGTGGAAAAGATCTGGGAAGAAGTCGGTTAAGGAATTGGAGCCACCGAAGATCGTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2196 bp · LXL04_018020|LXL04_018020|OH1004|CDS

ATGCAATCTGAATCCGTGGAAACATCGCTGTTTGATTTGTTGACCGCAGCTCTCAAGGGGAAACTTATAGGCAGTGTTAACGGATCGGATAGCGGAGACTCAACGATGCCGCTGGCTTTGGCGACGATTTTGGAAAATCGTGAGCTCTTGGTGATACTGACAACGTCAGTTGCTGTTTTGGTAGGATGTTTTGTTGTTCTGGTGTGGAAAAGATCTGGGAAGAAGTCGGTTAAGGAATTGGAGCCACCGAAGATCGTTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

731 aa · LXL04_018020|LXL04_018020|OH1004|PROTEIN

MQSESVETSLFDLLTAALKGKLIGSVNGSDSGDSTMPLALATILENRELLVILTTSVAVLVGCFVVLVWKRSGKKSVKELEPPKIVVPKRQLEEEVDDGKKKVTIFFGTQTGTAEGFAKALFEEAKVRYEKASFKVIDLDDYAADDDEYEQKLKKESFAFFFLATYGDGEPTDNAARFYKWFTEGEEKAQFNKLHYGVFGLGNRQYEHFNKIAKVVDDGLADQGAKRLVPVGLGDDDQSIEDDFSAWKELVWPELDQLLR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018020`
TK1151 ID	TkA08G033200
OH-1004 ID	LXL04_018020
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	95.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018020

位置 Chr04:5180307-5184219 (+)

描述 Similar to CPR: NADPH--cytochrome P450 reductase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g30210`	该酶对微体中从NADP到细胞色素P450的电子转移必不可少。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0558900`	该酶在微体中将电子从 NADP 转移到细胞色素 P450 所必需（通过相似性推测）。	Rice P450 reductases differentially affect P450-mediated metabolism in bacterial expression systems.2013 · DOI: 10.1007/s00449-012-0787-0

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018020 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009698 phenylpropanoid metabolic process 生物过程

GO:0051762 sesquiterpene biosynthetic process 生物过程

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0003958 NADPH-hemoprotein reductase activity 分子功能

GO:0010181 FMN binding 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G30210

dosa:Os09g0558900

osa:4347838

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.364

排名 1 · LXL04_018020 · OH-1004

内质网0.303

排名 2 · LXL04_018020 · OH-1004

线粒体0.183

排名 3 · LXL04_018020 · OH-1004

细胞核0.161

排名 4 · LXL04_018020 · OH-1004

高尔基体0.128

排名 5 · LXL04_018020 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00258.31Flavodoxin_1105-247 aa

PF00667.27FAD_binding_1303-419 aa

PF00667.27FAD_binding_1446-553 aa

PF00175.27NAD_binding_1585-695 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018020	`PF00258.31`	Flavodoxin_1	105	247	3.1e-31	109.2
LXL04_018020	`PF00667.27`	FAD_binding_1	303	419	4.6e-65	220.0
LXL04_018020	`PF00667.27`	FAD_binding_1	446	553	4.6e-65	220.0
LXL04_018020	`PF00175.27`	NAD_binding_1	585	695	8.2e-18	65.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SUM3`	拟南芥	NADPH--cytochrome P450 reductase 2	69.945%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q653S9`	水稻	NADPH--cytochrome P450 reductase 3	66.756%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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