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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_017875
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 2668825-2670369 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1545 bp · LXL04_017875|LXL04_017875|OH1004|cDNA

ATGGAAGCTGAGCTCATGATCGTCTTTATGGTGGTAGCCACCGCTTCAGCCTACCTCGTATGGTTCCACCACCTCTCCCGTCGTCTTTCTGGCCCCAAAGTCTATCCTTTCTTCGGCAGCATTCCTGTTCTCTTCCTTAATAGGTCTCGCATCCATGACTGGATAGCTGGAAACCTAAGATCTTCCGGCAGTGGTGGGACTTATCAGACCACCACCATCGCCATACCCTTCTTCGCACGTAAACAAGGGTTTTACACTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1545 bp · LXL04_017875|LXL04_017875|OH1004|CDS

ATGGAAGCTGAGCTCATGATCGTCTTTATGGTGGTAGCCACCGCTTCAGCCTACCTCGTATGGTTCCACCACCTCTCCCGTCGTCTTTCTGGCCCCAAAGTCTATCCTTTCTTCGGCAGCATTCCTGTTCTCTTCCTTAATAGGTCTCGCATCCATGACTGGATAGCTGGAAACCTAAGATCTTCCGGCAGTGGTGGGACTTATCAGACCACCACCATCGCCATACCCTTCTTCGCACGTAAACAAGGGTTTTACACTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

514 aa · LXL04_017875|LXL04_017875|OH1004|PROTEIN

MEAELMIVFMVVATASAYLVWFHHLSRRLSGPKVYPFFGSIPVLFLNRSRIHDWIAGNLRSSGSGGTYQTTTIAIPFFARKQGFYTVTCNPKNIEHILRTRFDNYPKGPTWQTAFHDLLGQGIFNSDGETWLIQRKTAALEFTTRTLRQAMARWVSRTIKTRLWLILEKASEEHFPVDLQDLLLRLTFDNICGLTFGKDPETLSLELSENPFATAFDSATEATLQRLLYPGFLWRLKKLFGIGAEMRLRKSLQVVENYMT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_017875
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_017875
位置Chr04:2668825-2670369 (+)
描述Similar to CYP86A1: Cytochrome P450 86A1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58860 催化各种脂肪酸 的 omega-羟基化。
Molecular definitions of fatty acid hydroxylases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1002/prot.21335
CYP86A1 from Arabidopsis thaliana encodes a cytochrome P450-dependent fatty acid omega-hydroxylase.1998 · DOI: 10.1006/bbrc.1998.8156
At4g00360 催化各种脂肪酸 的 omega-羟基化。
Arabidopsis CYP86A2 represses Pseudomonas syringae type III genes and is required for cuticle development.2004 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7600290
Molecular definitions of fatty acid hydroxylases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1002/prot.21335
At2g45970 催化各种脂肪酸 的 omega-羟基化。
Functional analysis of the LACERATA gene of Arabidopsis provides evidence for different roles of fatty acid omega -hydroxylation in development.2001 · DOI: 10.1073/pnas.171285998
Molecular definitions of fatty acid hydroxylases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1002/prot.21335
At1g63710 催化各种脂肪酸 的 omega-羟基化。
Molecular definitions of fatty acid hydroxylases in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1002/prot.21335

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017875 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0008610 lipid biosynthetic process 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0035336 long-chain fatty-acyl-CoA metabolic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
GO:0016712 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AAZ39642
ath:AT1G63710
ath:AT2G45970
ath:AT4G00360
ath:AT5G58860
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.902
排名 1 · LXL04_017875 · OH-1004
细胞质0.048
排名 2 · LXL04_017875 · OH-1004
细胞膜0.045
排名 3 · LXL04_017875 · OH-1004
高尔基体0.037
排名 4 · LXL04_017875 · OH-1004
质体0.035
排名 5 · LXL04_017875 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067.28p45086-499 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_017875PF00067.28p450864991.4e-63216.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P48422拟南芥Cytochrome P450 86A177.912%Swiss-Prot强数据库同源证据
O23066拟南芥Cytochrome P450 86A263.743%Swiss-Prot强数据库同源证据
O80823拟南芥Cytochrome P450 86A863.462%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9CAD6拟南芥Cytochrome P450 86A763.301%Swiss-Prot强数据库同源证据

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