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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_017565
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 153545151-153551993 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

894 bp · LXL04_017565|LXL04_017565|OH1004|cDNA

ATGGAGAAGTTGCCTGAAACGCTATATGTCGATCCAGCCACCGGTCGATCTTCTTCCGCCGCCGGAGCAAAATCTGCAGCCAGGATAGAGCAGTGCATAGAATTGCTGCACCTGCCTTTGCAGAGAGAAGAAGCCCTTGCTCTGCTAAAcaggGAAcgaaaaaataaagaaatggcAGTGCAAATATGGAATTCTAAGAGTGTCTGCTTCTTCCTCCTACAGGAATTTTGCATGGCTTACAAGTTGTTGTCACCTCCTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

894 bp · LXL04_017565|LXL04_017565|OH1004|CDS

ATGGAGAAGTTGCCTGAAACGCTATATGTCGATCCAGCCACCGGTCGATCTTCTTCCGCCGCCGGAGCAAAATCTGCAGCCAGGATAGAGCAGTGCATAGAATTGCTGCACCTGCCTTTGCAGAGAGAAGAAGCCCTTGCTCTGCTAAACAGGGAACGAAAAAATAAAGAAATGGCAGTGCAAATATGGAATTCTAAGAGTGTCTGCTTCTTCCTCCTACAGGAATTTTGCATGGCTTACAAGTTGTTGTCACCTCCTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

297 aa · LXL04_017565|LXL04_017565|OH1004|PROTEIN

MEKLPETLYVDPATGRSSSAAGAKSAARIEQCIELLHLPLQREEALALLNRERKNKEMAVQIWNSKSVCFFLLQEFCMAYKLLSPPALNMKEATRVCNAVALLQSMASHPDTKMGIVRAKMPVFIYPFMNTTEQRLKHFDYLRLTSLGVIGALVKVEDANSPEIVHFLLETEVIPLCLRCIEVGGELAKTVAAFVISKILMYEEGQRYCGTFPERFYAVAQVLITTVDQFTGKPPLQLLKHVLHCFLRLSEVSRPCDALV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_017565
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_017565
位置Chr03:153545151-153551993 (+)
描述Similar to cnot9: CCR4-NOT transcription complex subunit 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017565 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000289 nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006402 mRNA catabolic process 生物过程
GO:0006417 regulation of translation 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0019221 cytokine-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0031047 regulatory ncRNA-mediated gene silencing 生物过程
GO:0032968 positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II 生物过程
GO:0033138 positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation 生物过程
GO:0033147 negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway 生物过程
GO:0045742 positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
dre:406632
mmu:58184
rno:301513
spo:2542094
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.690
排名 1 · LXL04_017565 · OH-1004
细胞核0.254
排名 2 · LXL04_017565 · OH-1004
细胞膜0.111
排名 3 · LXL04_017565 · OH-1004
高尔基体0.074
排名 4 · LXL04_017565 · OH-1004
溶酶体／液泡0.061
排名 5 · LXL04_017565 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04078.20Rcd136-293 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_017565PF04078.20Rcd1362936.1e-80269.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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