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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_016159
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 112579921-112580565 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

645 bp · LXL04_016159|LXL04_016159|OH1004|cDNA

ATGACATCTAACGGTGACCCAAAATCTTCACCACGTCTAACCGATCAAACATCATCCCTCCCAAGAAGAAGATTCCGGCGAATCAAAAGTGCCCCACTTCCCGACTCTTTTGGTCCTGAAATTAAAAACGCCACCGCATCTCTGCCACACCCCAAGTCCGCTTTCGATCTCTTTTACCTGAGTTACTGGAAGGCAGGTGTCGTCTTCTTTGCATATCTTACTGCAGGTATGATTTGCTTTCATCTAGCAGGACACCAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

645 bp · LXL04_016159|LXL04_016159|OH1004|CDS

ATGACATCTAACGGTGACCCAAAATCTTCACCACGTCTAACCGATCAAACATCATCCCTCCCAAGAAGAAGATTCCGGCGAATCAAAAGTGCCCCACTTCCCGACTCTTTTGGTCCTGAAATTAAAAACGCCACCGCATCTCTGCCACACCCCAAGTCCGCTTTCGATCTCTTTTACCTGAGTTACTGGAAGGCAGGTGTCGTCTTCTTTGCATATCTTACTGCAGGTATGATTTGCTTTCATCTAGCAGGACACCAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

214 aa · LXL04_016159|LXL04_016159|OH1004|PROTEIN

MTSNGDPKSSPRLTDQTSSLPRRRFRRIKSAPLPDSFGPEIKNATASLPHPKSAFDLFYLSYWKAGVVFFAYLTAGMICFHLAGHQISGKKTNSILDALYFTIVTMTTVGYGDLVPASNLTILLACLFVASGTLIVGLVLSKAADLLVEKQERLLVKALHMNETIGKAEILKKIKTKKVRNKCIILVVFLLVLMAAGTGIFISVEDLDFIHAFY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_016159
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_016159
位置Chr03:112579921-112580565 (-)
描述Similar to TPK1: Two-pore potassium channel 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55630 电压无关、大电导和钾选择性液泡膜离子通道。
TPK1 is a vacuolar ion channel different from the slow-vacuolar cation channel.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.065599
TPK1, a Ca(2+)-regulated Arabidopsis vacuole two-pore K(+) channel is activated by 14-3-3 proteins.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03255.x
At1g02510 电压无关、瞬间激活、钾选择性的质膜离子通道。 暂无已核实直接文献
At5g46370 可能的电压非依赖性钾选择性液泡膜离子通道。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0752300 高选择性内向整流钾通道，专门位于大液泡的液泡膜中。
Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463
Os07g0108800 高选择性内向整流钾通道，特异性位于蛋白贮藏液泡的液泡膜上。
Rice two-pore K+ channels are expressed in different types of vacuoles.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081463
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016159 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0071257 cellular response to electrical stimulus 生物过程
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0097623 potassium ion export across plasma membrane 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0031004 potassium ion-transporting ATPase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02510
ath:AT5G46370
ath:AT5G55630
dosa:Os03g0752300
dosa:Os07g0108800
osa:4334137
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.632
排名 1 · LXL04_016159 · OH-1004
溶酶体／液泡0.133
排名 2 · LXL04_016159 · OH-1004
细胞质0.127
排名 3 · LXL04_016159 · OH-1004
内质网0.116
排名 4 · LXL04_016159 · OH-1004
高尔基体0.057
排名 5 · LXL04_016159 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520.38Ion_trans66-140 aa
PF07885.23Ion_trans_268-148 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_016159PF00520.38Ion_trans661404.7e-0729.9
LXL04_016159PF07885.23Ion_trans_2681481.2e-1557.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LBL1拟南芥Two-pore potassium channel 154.362%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FWX6拟南芥Two-pore potassium channel 430.055%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FL25拟南芥Two-pore potassium channel 227.848%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q850M0水稻Two pore potassium channel a41.262%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8LIN5水稻Two pore potassium channel b44.041%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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