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基因概览

LXL04_015698

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 80593270-80597323 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2211 bp · LXL04_015698|LXL04_015698|OH1004|cDNA

ATGGATCACACAGTAGGTCCCAGTGAGGAGGTTCCGGTGGCCGTCGACGATAATGCCGGCACTGTAACCAATAGCCGTTTTCATATTGCGActtgttcatcttcttcttcctgcAACCAACAGGGCACTAAAGGGTGGGGCACTATATTGCTTGCTTACAAGTCATTAGGAGTTGTCTTTGGAGGGCTTGTGACTTCTCCACTTTATGTGTACCCTTCAATGGCATTAAAGTCTCCAACAAAAGAAGACTACTTGGGAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2211 bp · LXL04_015698|LXL04_015698|OH1004|CDS

ATGGATCACACAGTAGGTCCCAGTGAGGAGGTTCCGGTGGCCGTCGACGATAATGCCGGCACTGTAACCAATAGCCGTTTTCATATTGCGACTTGTTCATCTTCTTCTTCCTGCAACCAACAGGGCACTAAAGGGTGGGGCACTATATTGCTTGCTTACAAGTCATTAGGAGTTGTCTTTGGAGGGCTTGTGACTTCTCCACTTTATGTGTACCCTTCAATGGCATTAAAGTCTCCAACAAAAGAAGACTACTTGGGAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

736 aa · LXL04_015698|LXL04_015698|OH1004|PROTEIN

MDHTVGPSEEVPVAVDDNAGTVTNSRFHIATCSSSSSCNQQGTKGWGTILLAYKSLGVVFGGLVTSPLYVYPSMALKSPTKEDYLGIYSIMFWTLTLIGVVKYACIALKADDQGEGGTFALYSLLCRHMNIGSITSTSVSSQSSHSYNNLHQGFEKPSRLGMFIERSLIARRVLFFIAILGMCMLIGDGILTPAISVLSAMDGIRGPYPEFSNSLVEALSALVLVILFLVQKYGTARVSFLFSPIMGAWTLTTPLIGIYN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_015698`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_015698

位置 Chr03:80593270-80597323 (-)

描述 Similar to HAK17: Probable potassium transporter 17

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30070`	高亲和力钾转运蛋白，在根际钾的吸收中发挥重要作用。	AtKUP1: an Arabidopsis gene encoding high-affinity potassium transport activity.1998 · DOI: 10.1105/tpc.10.1.51

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0448200`	高亲和力钾转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`Os08g0466200`	高亲和力钾转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`Os08g0510300`	高亲和力钾转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`Os01g0932500`	高亲和力钾转运蛋白。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015698 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006813 potassium ion transport 生物过程

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0015079 potassium ion transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G30070

dosa:Os01g0932500

dosa:Os08g0466200

dosa:Os08g0510300

dosa:Os09g0448200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.451

排名 1 · LXL04_015698 · OH-1004

溶酶体／液泡0.328

排名 2 · LXL04_015698 · OH-1004

细胞质0.153

排名 3 · LXL04_015698 · OH-1004

内质网0.112

排名 4 · LXL04_015698 · OH-1004

高尔基体0.088

排名 5 · LXL04_015698 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02705.23K_trans50-330 aa

PF02705.23K_trans338-544 aa

PF22776.1K_trans_C573-734 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_015698	`PF02705.23`	K_trans	50	330	4.2e-144	481.2
LXL04_015698	`PF02705.23`	K_trans	338	544	4.2e-144	481.2
LXL04_015698	`PF22776.1`	K_trans_C	573	734	2.6e-15	57.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22397`	拟南芥	Potassium transporter 1	38.202%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q67UC7`	水稻	Probable potassium transporter 17	62.979%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q6YSA9`	水稻	Probable potassium transporter 4	60.942%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q84YJ9`	水稻	Potassium transporter 26	44.300%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q5JMH0`	水稻	Potassium transporter 6	43.830%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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