基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_015466
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 72853450-72858332
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3380 bp · LXL04_015466|LXL04_015466|OH1004|cDNA
ATGGAGCCAGATGTCAGCATCGCCACTAGTTCCATGATCCGGATCGCCGTTATCCCGGTCGGAGAAATCCACCTGCACCTCTTCCGCAAATACGCCGGGATGCTCGACCGCCACCACAAGATCGAACTCTCAACTATCACTTCTTTCTACAAAGTAGACAAGAAATCTCCATTCCAACAGCAGCCATGGGAATCCGGTAGTTTAAGGTTCAAGTTCATTGTAGGCGGATCGCCGCCTAGTCCATGGGAGGATTTCCAATC...
CDS
下载 CDS FASTA3360 bp · LXL04_015466|LXL04_015466|OH1004|CDS
ATGGAGCCAGATGTCAGCATCGCCACTAGTTCCATGATCCGGATCGCCGTTATCCCGGTCGGAGAAATCCACCTGCACCTCTTCCGCAAATACGCCGGGATGCTCGACCGCCACCACAAGATCGAACTCTCAACTATCACTTCTTTCTACAAAGTAGACAAGAAATCTCCATTCCAACAGCAGCCATGGGAATCCGGTAGTTTAAGGTTCAAGTTCATTGTAGGCGGATCGCCGCCTAGTCCATGGGAGGATTTCCAATC...
1119 aa · LXL04_015466|LXL04_015466|OH1004|PROTEIN
MEPDVSIATSSMIRIAVIPVGEIHLHLFRKYAGMLDRHHKIELSTITSFYKVDKKSPFQQQPWESGSLRFKFIVGGSPPSPWEDFQSNRKIHGVIGICYCPSSPDLGSVAEQFAVACKGYASSVVQRCFVFSPGDKQLADGNNNKNKLVLFPPADQRAQEIHLQTMMQEIAASLLMEFEKWVSRPESGGIILKTPLDSQASLSSEEVIKATKRRLGRAQKTTGDYCLLAGSPVDANAHYSTALELARLTGDHFWYAGAME...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_015466 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_015466 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:72853450-72858332 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to TRS120: Trafficking protein particle complex II-specific subunit 120 homolog | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程 GO:0000919 cell plate assembly 生物过程 GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0006901 vesicle coating 生物过程 GO:0030154 cell differentiation 生物过程 GO:0099022 vesicle tethering 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005769 early endosome 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G11040 bta:533451 dosa:Os04g0502200 hsa:83696 mmu:76510 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.520
细胞核0.304
高尔基体0.188
内质网0.091
溶酶体／液泡0.076
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08626.17TRAPPC9-Trs1206-185 aaPF08626.17TRAPPC9-Trs120204-269 aaPF26251.1TPR_TRAPPC9-Trs120330-493 aaPF26254.1Ig_TRAPPC9-Trs120_1st540-642 aaPF26280.1Ig_TRAPPC9-Trs120_2nd691-744 aaPF26282.1Ig_TRAPPC9-Trs120_3rd834-977 aaPF26283.1Ig_TRAPPC9-Trs120_4th996-1115 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_015466 | PF08626.17 | TRAPPC9-Trs120 | 6 | 185 | 1.3e-31 | 110.7 |
| LXL04_015466 | PF08626.17 | TRAPPC9-Trs120 | 204 | 269 | 1.3e-31 | 110.7 |
| LXL04_015466 | PF26251.1 | TPR_TRAPPC9-Trs120 | 330 | 493 | 8.4e-13 | 49.1 |
| LXL04_015466 | PF26254.1 | Ig_TRAPPC9-Trs120_1st | 540 | 642 | 1.7e-22 | 80.8 |
| LXL04_015466 | PF26280.1 | Ig_TRAPPC9-Trs120_2nd | 691 | 744 | 1.7e-08 | 35.3 |
| LXL04_015466 | PF26282.1 | Ig_TRAPPC9-Trs120_3rd | 834 | 977 | 1.5e-11 | 45.2 |
| LXL04_015466 | PF26283.1 | Ig_TRAPPC9-Trs120_4th | 996 | 1115 | 1.4e-10 | 41.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。