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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_015411
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 71187949-71193191 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2565 bp · LXL04_015411|LXL04_015411|OH1004|cDNA

ATGGAGCCTGCCGTACCATCGCAACTTGTCGGTTCAGAGATTCATGGGTTTAAAACCATGCAAGATGTACCCACCATGTTTTTTCTGCCATTAACAGATTTAGATGTACCCACCATGTTCGAGGAAGCCAAGACAAGATGGCTTCGGCCAAATGAGATCCATGCAATTCTTTGTAACCACAAGCATTTCAACATTCACGTGAAGCCTGTGAATTTGCCAAAAAGTGGCACCATTGTCCTATTTGACCGAAAGATGCTCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2565 bp · LXL04_015411|LXL04_015411|OH1004|CDS

ATGGAGCCTGCCGTACCATCGCAACTTGTCGGTTCAGAGATTCATGGGTTTAAAACCATGCAAGATGTACCCACCATGTTTTTTCTGCCATTAACAGATTTAGATGTACCCACCATGTTCGAGGAAGCCAAGACAAGATGGCTTCGGCCAAATGAGATCCATGCAATTCTTTGTAACCACAAGCATTTCAACATTCACGTGAAGCCTGTGAATTTGCCAAAAAGTGGCACCATTGTCCTATTTGACCGAAAGATGCTCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

854 aa · LXL04_015411|LXL04_015411|OH1004|PROTEIN

MEPAVPSQLVGSEIHGFKTMQDVPTMFFLPLTDLDVPTMFEEAKTRWLRPNEIHAILCNHKHFNIHVKPVNLPKSGTIVLFDRKMLRNFRKDGYNWKKKKDGKTVKEAHEHLKVGNDERIHVYYAHGEDQSTFVRRCYWLLDKKLENIVLVHYRDTQELQGSPTIESNSSSDPPASWNLSGENDGVDQVYKTEPIETIINHKMRLHEINTLEWEELVVPDDSNKSITPQGGNISYFDQGDQYGLNGIVDTMDPGFMNSTT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_015411
TK1151 IDTkA02G336420
OH-1004 IDLXL04_015411
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_015411
位置Chr03:71187949-71193191 (-)
描述Similar to CAMTA5: Calmodulin-binding transcription activator 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16150 转录激活因子。
Arabidopsis CAMTA family proteins enhance V-PPase expression in pollen.2003 · DOI: 10.1093/pcp/pcg137
Different Cold-Signaling Pathways Function in the Responses to Rapid and Gradual Decreases in Temperature.2017 · DOI: 10.1105/tpc.16.00669
At3g16940 转录激活因子，可在体外钙依赖性结合钙调蛋白。
A novel family of calmodulin-binding transcription activators in multicellular organisms.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m200268200
At2g22300 转录激活因子，可结合 DNA 共识序列 5'-[ACG]CGCG[GTC]-3'。
Calmodulin-binding transcription activator (CAMTA) 3 mediates biotic defense responses in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2008.02.037
Ca(2+)/calmodulin regulates salicylic-acid-mediated plant immunity.2009 · DOI: 10.1038/nature07612
Roles for Arabidopsis CAMTA transcription factors in cold-regulated gene expression and freezing tolerance.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.063958
Brush and spray: a high-throughput systemic acquired resistance assay suitable for large-scale genetic screening.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182089
The calmodulin-binding transcription factor SIGNAL RESPONSIVE1 is a novel regulator of glucosinolate metabolism and herbivory tolerance in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1093/pcp/pcs143
Roles of CAMTA transcription factors and salicylic acid in configuring the low-temperature transcriptome and freezing tolerance of Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12205
A key general stress response motif is regulated non-uniformly by CAMTA transcription factors.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12620
Distinct roles for mitogen-activated protein kinase signaling and CALMODULIN-BINDING TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR3 in regulating the peak time and amplitude of the plant general stress response.2014 · DOI: 10.1104/pp.114.245944
Different Cold-Signaling Pathways Function in the Responses to Rapid and Gradual Decreases in Temperature.2017 · DOI: 10.1105/tpc.16.00669
Matching NLR Immune Receptors to Autoimmunity in camta3 Mutants Using Antimorphic NLR Alleles.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.03.005
At5g09410 转录激活因子，可在体外钙依赖性结合钙调蛋白。
A novel family of calmodulin-binding transcription activators in multicellular organisms.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m200268200
Arabidopsis CAMTA family proteins enhance V-PPase expression in pollen.2003 · DOI: 10.1093/pcp/pcg137
Roles for Arabidopsis CAMTA transcription factors in cold-regulated gene expression and freezing tolerance.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.063958
Calmodulin-binding transcription activator 1 mediates auxin signaling and responds to stresses in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1153-6
CAMTA 1 regulates drought responses in Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1186/1471-2164-14-216
Roles of CAMTA transcription factors and salicylic acid in configuring the low-temperature transcriptome and freezing tolerance of Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12205

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0490200 转录激活因子，可在体外钙依赖性结合钙调蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015411 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:0106167 extracellular ATP signaling 生物过程
GO:1900367 positive regulation of defense response to insect 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22300
ath:AT3G16940
ath:AT4G15200
ath:AT4G15950
ath:AT4G16150
ath:AT4G17100
ath:AT4G35335
dosa:Os07g0490200
osa:4343265
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.491
排名 1 · LXL04_015411 · OH-1004
细胞核0.441
排名 2 · LXL04_015411 · OH-1004
细胞膜0.128
排名 3 · LXL04_015411 · OH-1004
内质网0.046
排名 4 · LXL04_015411 · OH-1004
高尔基体0.043
排名 5 · LXL04_015411 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03859.22CG-142-155 aa
PF01833.31TIG305-390 aa
PF12796.14Ank_2487-569 aa
PF12796.14Ank_2530-602 aa
PF00023.37Ank541-571 aa
PF13637.13Ank_4545-599 aa
PF00612.34IQ732-751 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_015411PF03859.22CG-1421555.5e-46155.8
LXL04_015411PF01833.31TIG3053905.8e-0730.1
LXL04_015411PF12796.14Ank_24875695.3e-1350.1
LXL04_015411PF12796.14Ank_25306025.3e-1350.1
LXL04_015411PF00023.37Ank5415711.8e-0834.9
LXL04_015411PF13637.13Ank_45455998.5e-0626.7
LXL04_015411PF00612.34IQ7327518.5e-0832.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O23463拟南芥Calmodulin-binding transcription activator 553.152%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LSP8拟南芥Calmodulin-binding transcription activator 653.118%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8GSA7拟南芥Calmodulin-binding transcription activator 333.225%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FY74拟南芥Calmodulin-binding transcription activator 131.097%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7XHR2水稻Calmodulin-binding transcription activator CBT47.582%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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