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基因概览

LXL04_014777

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 56845642-56850124 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3135 bp · LXL04_014777|LXL04_014777|OH1004|cDNA

ATGACGAAGAAACCGCGAGTACCGGCGGTGCTATGGAAATTGTTCCAAAACCGTGCCCGCACACTCGCAGAAACCATGCTATCCTTAATACCTCCACCGTCGTCGGCGACGGTTCAATGCCGTTGCAAGGGTCGTCGACATTGCCTCCGATGTTGTTCCGTTGATGACCGTATGTCGTATCTGATCAGAGAAGACGACCCACCCGACTACTCTAAGCTCCTCAATCAATGTTTTGTGGTCGTCTCGGACAATGCGCCCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

3135 bp · LXL04_014777|LXL04_014777|OH1004|CDS

ATGACGAAGAAACCGCGAGTACCGGCGGTGCTATGGAAATTGTTCCAAAACCGTGCCCGCACACTCGCAGAAACCATGCTATCCTTAATACCTCCACCGTCGTCGGCGACGGTTCAATGCCGTTGCAAGGGTCGTCGACATTGCCTCCGATGTTGTTCCGTTGATGACCGTATGTCGTATCTGATCAGAGAAGACGACCCACCCGACTACTCTAAGCTCCTCAATCAATGTTTTGTGGTCGTCTCGGACAATGCGCCCTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1044 aa · LXL04_014777|LXL04_014777|OH1004|PROTEIN

MTKKPRVPAVLWKLFQNRARTLAETMLSLIPPPSSATVQCRCKGRRHCLRCCSVDDRMSYLIREDDPPDYSKLLNQCFVVVSDNAPSPPLFDPRSRWSQLEIVRMTIDMMSCEETSTKNMICTGYNKVGDGLMVYLLKYCSIFIPLHRKKHQQVAEKHHALDPVSMTVDIPETSSTCLGCNVKGSVTHIKHISKMSCHQDSTTDADCTGTTTTQENGVVGGAHSRKRVRSYAWQRRHKRRKLLSHNMCECDTNSSLPEDK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_014777`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_014777

位置 Chr03:56845642-56850124 (+)

描述 Similar to TERT: Telomerase reverse transcriptase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g16850`	端粒酶是一种核糖核蛋白酶，对于大多数真核生物中染色体末端的复制至关重要。	Molecular cloning and characterization of AtTERT, a telomerase reverse transcriptase homolog in Arabidopsis thaliana.1999 · DOI: 10.1016/s0014-5793(99)01083-2 Disruption of the telomerase catalytic subunit gene from Arabidopsis inactivates telomerase and leads to a slow loss of telomeric DNA.1999 · DOI: 10.1073/pnas.96.26.14813 Rearrangements of ribosomal DNA clusters in late generation telomerase-deficient Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1007/s00412-003-0251-7

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os12g0293100`	端粒酶是一种核糖核蛋白酶，对于大多数真核生物中染色体末端的复制至关重要。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014777 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000723 telomere maintenance 生物过程

GO:0007004 telomere maintenance via telomerase 生物过程

GO:0010073 meristem maintenance 生物过程

GO:0010449 root meristem growth 生物过程

GO:0019827 stem cell population maintenance 生物过程

GO:0050000 chromosome localization 生物过程

GO:0000333 telomerase catalytic core complex 细胞组分

GO:0000781 chromosome, telomeric region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005697 telomerase holoenzyme complex 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G16850

bta:518884

cfa:403412

dosa:Os12g0293100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.871

排名 1 · LXL04_014777 · OH-1004

细胞质0.153

排名 2 · LXL04_014777 · OH-1004

线粒体0.035

排名 3 · LXL04_014777 · OH-1004

细胞膜0.026

排名 4 · LXL04_014777 · OH-1004

内质网0.014

排名 5 · LXL04_014777 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12009.14Telomerase_RBD388-516 aa

PF00078.33RVT_1568-821 aa

PF21399.3TERT_C885-1011 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_014777	`PF12009.14`	Telomerase_RBD	388	516	2.5e-37	128.7
LXL04_014777	`PF00078.33`	RVT_1	568	821	4.2e-11	43.8
LXL04_014777	`PF21399.3`	TERT_C	885	1011	3e-18	67.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SPU7`	拟南芥	Telomerase reverse transcriptase	35.324%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q8LKW0`	水稻	Telomerase reverse transcriptase	36.768%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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