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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_014707
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 55161027-55162499 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1473 bp · LXL04_014707|LXL04_014707|OH1004|cDNA

ATGTGCTTGTGTTCATCCACCATACATTCACCTTCTATTCACAGTAGTCCATCATCTGAAGTCGATCACATGACCCAGATGCAAGGCATAGTATCTATCCTTGGATCCGACAACCATGAAAGGACCACCAGGGCCGGGTCGCTCCGGCGCACTCTGTCTGCAGACATGTCATCCAAGAAGTGGATGGCTGATAATGGTTTATCAGTCTCTCCCACGATGAAGAAGATCGCTTCATCGGAGCAGATCGCGACTGATTTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1473 bp · LXL04_014707|LXL04_014707|OH1004|CDS

ATGTGCTTGTGTTCATCCACCATACATTCACCTTCTATTCACAGTAGTCCATCATCTGAAGTCGATCACATGACCCAGATGCAAGGCATAGTATCTATCCTTGGATCCGACAACCATGAAAGGACCACCAGGGCCGGGTCGCTCCGGCGCACTCTGTCTGCAGACATGTCATCCAAGAAGTGGATGGCTGATAATGGTTTATCAGTCTCTCCCACGATGAAGAAGATCGCTTCATCGGAGCAGATCGCGACTGATTTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

490 aa · LXL04_014707|LXL04_014707|OH1004|PROTEIN

MCLCSSTIHSPSIHSSPSSEVDHMTQMQGIVSILGSDNHERTTRAGSLRRTLSADMSSKKWMADNGLSVSPTMKKIASSEQIATDFSSSEEDEEECEMTKNANKNPSRIDIWTAIMSQKVQDDSVKLPPPYVHPLVKKSASSLSEKSLKVCTESLGSETGSDVFSSYPSSEASDENKVQENQEENEEIKDADAEEQKVVKHATCLTTKKPQQTRSLPPPLSSLSTARTDGPSLHMHSHRVDGRLVLEAVSVPQQNYFEAQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_014707
TK1151 IDTkA02G403840
OH-1004 IDLXL04_014707
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)82.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 76.531
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_014707
位置Chr03:55161027-55162499 (-)
描述Similar to At5g22090: Protein FAF-like, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g22090 FAF样蛋白，叶绿体型。 暂无已核实直接文献
At5g19260 在持续过表达时能够抑制WUS，但对CLV3没有影响。 暂无已核实直接文献
At1g03170 通过调节 CLV3-WUS 反馈回路来控制芽分生组织的大小。
The FANTASTIC FOUR proteins influence shoot meristem size in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1186/1471-2229-10-285
At3g06020 通过调节 CLV3-WUS 反馈回路来控制芽分生组织的大小。
The FANTASTIC FOUR proteins influence shoot meristem size in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1186/1471-2229-10-285

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014707 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0042326 negative regulation of phosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0019902 phosphatase binding 分子功能
GO:0072542 protein phosphatase activator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03170
ath:AT3G06020
ath:AT5G19260
ath:AT5G22090
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.417
排名 1 · LXL04_014707 · OH-1004
细胞核0.399
排名 2 · LXL04_014707 · OH-1004
细胞膜0.361
排名 3 · LXL04_014707 · OH-1004
内质网0.063
排名 4 · LXL04_014707 · OH-1004
质体0.036
排名 5 · LXL04_014707 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11250.14FAF215-270 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_014707PF11250.14FAF2152707.5e-2071.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0V865拟南芥Protein FAF-like, chloroplastic36.089%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q6NMR8拟南芥Protein FANTASTIC FOUR 330.597%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8GXU9拟南芥Protein FANTASTIC FOUR 233.103%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SFG6拟南芥Protein FANTASTIC FOUR 430.921%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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