基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_014554
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 52407379-52409766
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1251 bp · LXL04_014554|LXL04_014554|OH1004|cDNA
ATGGAGAAAAATGATAATAACTACTCGGGAGGTTTGCTTGGAGTGGACTTCAATGGTGATCATGACCATGAGTATTATCAACACCACAATCAACAACAGCTACAACAGCAGTTTATGGTGAAAAACGCATACGAAAACGGGAACCAAATGGTGGATTACATGCTCAATAATCCGATACAACATCTACCTTCTGGTGGGTTTTGTAGCTCAAACTCGTTGGATAAGTTAAGTTTTGCAGATGTAATGCAGTTTGCAGATCT...
CDS
下载 CDS FASTA1251 bp · LXL04_014554|LXL04_014554|OH1004|CDS
ATGGAGAAAAATGATAATAACTACTCGGGAGGTTTGCTTGGAGTGGACTTCAATGGTGATCATGACCATGAGTATTATCAACACCACAATCAACAACAGCTACAACAGCAGTTTATGGTGAAAAACGCATACGAAAACGGGAACCAAATGGTGGATTACATGCTCAATAATCCGATACAACATCTACCTTCTGGTGGGTTTTGTAGCTCAAACTCGTTGGATAAGTTAAGTTTTGCAGATGTAATGCAGTTTGCAGATCT...
416 aa · LXL04_014554|LXL04_014554|OH1004|PROTEIN
MEKNDNNYSGGLLGVDFNGDHDHEYYQHHNQQQLQQQFMVKNAYENGNQMVDYMLNNPIQHLPSGGFCSSNSLDKLSFADVMQFADLGPKLALNQNKTKHGHDDDQENGIDPVYFLKFPVLNERVQEDHHHQSLLAPLEDDENEHRVMIEGGDQRDDDARVSDTSVRLQFIGDDAHKTLVGDGKNKRKRPRTIKTSEEVESQRMTHIAVERNRRKQMNEHLRVLRSLMPGSYVQRGDQASIIGGAIEFVRELEQLLQCLE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_014554 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_014554 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:52407379-52409766 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to FAMA: Transcription factor FAMA | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0010052 guard cell differentiation 生物过程 GO:0010374 stomatal complex development 生物过程 GO:0010377 guard cell fate commitment 生物过程 GO:0010444 guard mother cell differentiation 生物过程 GO:0045597 positive regulation of cell differentiation 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0051782 negative regulation of cell division 生物过程 GO:0090547 response to low humidity 生物过程 GO:0090627 plant epidermal cell differentiation 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G22490 ath:AT1G72210 ath:AT3G06120 ath:AT3G24140 ath:AT4G01460 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.967
细胞质0.088
细胞膜0.032
内质网0.024
质体0.013
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00010.32HLH202-253 aaPF22754.5bHLH-TF_ACT-like_plant319-396 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_014554 | PF00010.32 | HLH | 202 | 253 | 8.1e-12 | 45.5 |
| LXL04_014554 | PF22754.5 | bHLH-TF_ACT-like_plant | 319 | 396 | 1.6e-08 | 35.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q56YJ8 | 拟南芥 | Transcription factor FAMA | 56.863% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SK91 | 拟南芥 | Transcription factor bHLH94 | 44.335% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9M8K6 | 拟南芥 | Transcription factor MUTE | 44.615% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9C7T4 | 拟南芥 | Transcription factor bHLH96 | 42.439% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9M128 | 拟南芥 | Transcription factor bHLH57 | 42.723% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |