基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_014377
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 47818931-47831409
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA5208 bp · LXL04_014377|LXL04_014377|OH1004|cDNA
atgggtagggtggccggtggaggctggaatcacgccggaaaatcccgaaaacttaacCGGAACTACACTTCAAAGCACAACTTATCGAGACAGCAAGCGAATATAGGACTAGAAGCTTACCGGGAAGATGAGGACTgccggtggtggtcgccggtgcacaagGCGGACGCGACAGAAAGAGTAAGGTTGCCGGAGGGAAGGAAAAAGGCTCATGAACCAAACTGCCGGCGGAAGATCTTCACAGCAGCACAGGTGACGCG...
CDS
下载 CDS FASTA5208 bp · LXL04_014377|LXL04_014377|OH1004|CDS
ATGGGTAGGGTGGCCGGTGGAGGCTGGAATCACGCCGGAAAATCCCGAAAACTTAACCGGAACTACACTTCAAAGCACAACTTATCGAGACAGCAAGCGAATATAGGACTAGAAGCTTACCGGGAAGATGAGGACTGCCGGTGGTGGTCGCCGGTGCACAAGGCGGACGCGACAGAAAGAGTAAGGTTGCCGGAGGGAAGGAAAAAGGCTCATGAACCAAACTGCCGGCGGAAGATCTTCACAGCAGCACAGGTGACGCG...
1735 aa · LXL04_014377|LXL04_014377|OH1004|PROTEIN
MGRVAGGGWNHAGKSRKLNRNYTSKHNLSRQQANIGLEAYREDEDCRWWSPVHKADATERVRLPEGRKKAHEPNCRRKIFTAAQVTRRNASSELKEDAGKNGAGTAGKQSPILAAIANQIFTVHRRRRELSPEEVQSSGGGAMAGQRAATIRVNFWFREDDEEGRDARDLNPARFMQFQKNDNQPLLLWRYYHLTPLLTNYFISVSLPDRGPVTMGPWYGVIRVLRRLREHHMDLMSLCPMRLGNGLSTDIWHGRWWDGG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_014377 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_014377 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:47818931-47831409 (-) |
| 描述 | Similar to FER: Receptor-like protein kinase FERONIA |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009791 post-embryonic development 生物过程 GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程 GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010038 response to metal ion 生物过程 GO:0010118 stomatal movement 生物过程 GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0010483 pollen tube reception 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G46290 ath:AT3G51550 ath:AT5G28680 ath:AT5G39000 ath:AT5G59700 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.530
细胞核0.327
细胞膜0.198
高尔基体0.074
内质网0.058
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13966.12zf-RVT336-420 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr532-807 aaPF00069.32Pkinase533-803 aaPF04065.21Not3863-1095 aaPF04153.25NOT2_3_5_C1591-1729 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_014377 | PF13966.12 | zf-RVT | 336 | 420 | 1.8e-14 | 54.8 |
| LXL04_014377 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 532 | 807 | 2e-46 | 159.1 |
| LXL04_014377 | PF00069.32 | Pkinase | 533 | 803 | 1.7e-45 | 156.2 |
| LXL04_014377 | PF04065.21 | Not3 | 863 | 1095 | 3.8e-81 | 272.6 |
| LXL04_014377 | PF04153.25 | NOT2_3_5_C | 1591 | 1729 | 6.6e-32 | 111.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SCZ4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase FERONIA | 45.875% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LX66 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase HERK 1 | 47.727% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FN92 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At5g59700 | 47.403% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FID8 | 拟南芥 | Putative receptor-like protein kinase At5g39000 | 45.277% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q3E8W4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR2 | 45.141% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |