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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

LXL04_014345
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 46868283-46875355 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1698 bp · LXL04_014345|LXL04_014345|OH1004|cDNA

ATGGATATTGGCACATCTGGTTCTTCCTATGCTAACTTTGTGGTACCTTTTATGATATGCGAATGCACACATGGACATGCTGAGATGTCAATTACTACGAGTCAACTAAAGTCAAAAGCCATGTCAGCAAGTTTTACTGAGAAACCAGTTGTCGATTGCAAAACTGAACCAGTATTATCACCAAAGCATGTCTTCTTCTCAACCAAAACCAAAGCCAGAAAATCAAAACCAAAAGCCAAGAACACTCCCTCACCAAACCT...

1698 bp · LXL04_014345|LXL04_014345|OH1004|CDS

ATGGATATTGGCACATCTGGTTCTTCCTATGCTAACTTTGTGGTACCTTTTATGATATGCGAATGCACACATGGACATGCTGAGATGTCAATTACTACGAGTCAACTAAAGTCAAAAGCCATGTCAGCAAGTTTTACTGAGAAACCAGTTGTCGATTGCAAAACTGAACCAGTATTATCACCAAAGCATGTCTTCTTCTCAACCAAAACCAAAGCCAGAAAATCAAAACCAAAAGCCAAGAACACTCCCTCACCAAACCT...

565 aa · LXL04_014345|LXL04_014345|OH1004|PROTEIN

MDIGTSGSSYANFVVPFMICECTHGHAEMSITTSQLKSKAMSASFTEKPVVDCKTEPVLSPKHVFFSTKTKARKSKPKAKNTPSPNLNQPISSTHQQQPQSFYRNIQDQLMYSPQHYHMPPNMYGYPSNYMSYQMPLQNIQPQNQPQTQNQPQNQTQMQHQNLDDFNLYDPNFLTQFQTQMQHQSQSQSQPQPQQPFQTTQPRRLCDEESSNEDEEEVNFNYNLEDEDDEPEPEPEPEPEPEPPSRKRGKGKGKEKEPVQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_014345
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_014345
位置Chr03:46868283-46875355 (-)
描述Similar to GC1: Golgin candidate 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g19950 高尔基体基质蛋白在将囊泡束缚到高尔基体膜和维持高尔基体的整体结构中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0744400 可能参与高尔基体结构维持和高尔基体内运输。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_014345 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0000301 retrograde transport, vesicle recycling within Golgi 生物过程
GO:0007030 Golgi organization 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0031985 Golgi cisterna 细胞组分
GO:0030674 protein-macromolecule adaptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19950
dosa:Os01g0744400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.923
排名 1 · LXL04_014345 · OH-1004
细胞质0.218
排名 2 · LXL04_014345 · OH-1004
线粒体0.023
排名 3 · LXL04_014345 · OH-1004
细胞膜0.017
排名 4 · LXL04_014345 · OH-1004
内质网0.010
排名 5 · LXL04_014345 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S8N9拟南芥Golgin candidate 141.270%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q5JLY8水稻Golgin-8444.554%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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