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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_013908
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 37755933-37774287 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6912 bp · LXL04_013908|LXL04_013908|OH1004|cDNA

ATGCATCCAAGAGGCTGCTCTTCTCTGGTGTACATGAAGCCAACCTTTTGTAAGAGAATGCCTAAGAATCTAGTTTGGGTATTCCTCTTGTTGATGGTCAATTTCCATGGATGCTTCGCTAAAGGGCTTAATAACACCAGCGTTTCTACAAGACCAAGTGTCGTGAATATTGCATCTATCTTGACATTCGATTCCATAATTGGAAAAGTCGCTAAAATTGCTTTACAAGCTGCAATTGAAGACGTCAACTCTGATCCCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

6912 bp · LXL04_013908|LXL04_013908|OH1004|CDS

ATGCATCCAAGAGGCTGCTCTTCTCTGGTGTACATGAAGCCAACCTTTTGTAAGAGAATGCCTAAGAATCTAGTTTGGGTATTCCTCTTGTTGATGGTCAATTTCCATGGATGCTTCGCTAAAGGGCTTAATAACACCAGCGTTTCTACAAGACCAAGTGTCGTGAATATTGCATCTATCTTGACATTCGATTCCATAATTGGAAAAGTCGCTAAAATTGCTTTACAAGCTGCAATTGAAGACGTCAACTCTGATCCCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2303 aa · LXL04_013908|LXL04_013908|OH1004|PROTEIN

MHPRGCSSLVYMKPTFCKRMPKNLVWVFLLLMVNFHGCFAKGLNNTSVSTRPSVVNIASILTFDSIIGKVAKIALQAAIEDVNSDPNILIGTKLKITLHDSNFSAFMSMMEALQVMETDTVALIGPQSSVLPHVISHVANELQVPLLSFTATDPTLNSLQYPFFVRTTHSDLYQMAAIADIIKYYEWRKVTAIYFDDDHGRNGIISLGDQLASRGCEISHKAPIKPLATKSDISDVLVQVALMESRILVVHTYPHYGLDI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_013908
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_013908
位置Chr03:37755933-37774287 (+)
描述Similar to GLR3.6: Glutamate receptor 3.6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51480 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
At1g42540 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道，至少在根和下胚轴中（可能）。
Calcium entry mediated by GLR3.3, an Arabidopsis glutamate receptor with a broad agonist profile.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088989
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Glutamate receptor-like channel3.3 is involved in mediating glutathione-triggered cytosolic calcium transients, transcriptional changes, and innate immunity responses in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217208
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to Hyaloperonospora arabidopsidis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12311
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
Real-time, in vivo intracellular recordings of caterpillar-induced depolarization waves in sieve elements using aphid electrodes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12807
At4g35290 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道（可能）。
Overexpression of the AtGluR2 gene encoding an Arabidopsis homolog of mammalian glutamate receptors impairs calcium utilization and sensitivity to ionic stress in transgenic plants.2001 · DOI: 10.1093/pcp/pce008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
At2g17260 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
De-regulated expression of the plant glutamate receptor homolog AtGLR3.1 impairs long-term Ca2+-programmed stomatal closure.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03789.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0585200 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
A rice glutamate receptor-like gene is critical for the division and survival of individual cells in the root apical meristem.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037713
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013908 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G42540
ath:AT3G51480
osa:124544569
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.747
排名 1 · LXL04_013908 · OH-1004
内质网0.099
排名 2 · LXL04_013908 · OH-1004
细胞质0.073
排名 3 · LXL04_013908 · OH-1004
溶酶体／液泡0.071
排名 4 · LXL04_013908 · OH-1004
细胞核0.040
排名 5 · LXL04_013908 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13458.13Peripla_BP_666-351 aa
PF01094.35ANF_receptor72-425 aa
PF10613.15Lig_chan-Glu_bd500-587 aa
PF00497.26SBP_bac_3542-824 aa
PF00060.33Lig_chan606-857 aa
PF22794.2jr-ZPR1991-1098 aa
PF03367.20Zn_ribbon_ZPR11147-1202 aa
PF22794.2jr-ZPR11216-1249 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_013908PF13458.13Peripla_BP_6663512.9e-28100.2
LXL04_013908PF01094.35ANF_receptor724255.6e-174578.9
LXL04_013908PF10613.15Lig_chan-Glu_bd5005879.6e-1968.3
LXL04_013908PF00497.26SBP_bac_35428245.9e-2485.0
LXL04_013908PF00060.33Lig_chan6068572.7e-75251.8
LXL04_013908PF22794.2jr-ZPR199110981.1e-46158.5
LXL04_013908PF03367.20Zn_ribbon_ZPR1114712027.3e-2586.9
LXL04_013908PF22794.2jr-ZPR1121612491.1e-46158.5
LXL04_013908PF13458.13Peripla_BP_6142517092.9e-28100.2
LXL04_013908PF01094.35ANF_receptor143117845.6e-174578.9
LXL04_013908PF10613.15Lig_chan-Glu_bd185919449.6e-1968.3
LXL04_013908PF00497.26SBP_bac_3186121815.9e-2485.0
LXL04_013908PF00060.33Lig_chan196322132.7e-75251.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84W41拟南芥Glutamate receptor 3.660.000%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C8E7拟南芥Glutamate receptor 3.356.536%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q93YT1拟南芥Glutamate receptor 3.253.070%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q7XJL2拟南芥Glutamate receptor 3.154.218%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q7XP59水稻Glutamate receptor 3.152.643%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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