基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_013573
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 31973425-31974426
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1002 bp · LXL04_013573|LXL04_013573|OH1004|cDNA
ATGGATCGAATCAAAGGCCCATGGAGCCCCGATGAAGACGAGTTGCTGCAGCAGCTTGTCGAGAAGCATGGCCCGAGAAATTGGTCGCTTATCAGCAAATCTATACCTGGTAGATCTGGTAAATCGTGCCGGTTGCGGTGGTGTAACCAGCTGTCGCCGCAGGTGGAACACCGGGCTTTTACGCCGGAAGAGGATGAAACGATCCTACGCGCTCATGCCCGGTTTGGTAACAAATGGGCGACGATTGCCCGGCTTTTATC...
CDS
下载 CDS FASTA1002 bp · LXL04_013573|LXL04_013573|OH1004|CDS
ATGGATCGAATCAAAGGCCCATGGAGCCCCGATGAAGACGAGTTGCTGCAGCAGCTTGTCGAGAAGCATGGCCCGAGAAATTGGTCGCTTATCAGCAAATCTATACCTGGTAGATCTGGTAAATCGTGCCGGTTGCGGTGGTGTAACCAGCTGTCGCCGCAGGTGGAACACCGGGCTTTTACGCCGGAAGAGGATGAAACGATCCTACGCGCTCATGCCCGGTTTGGTAACAAATGGGCGACGATTGCCCGGCTTTTATC...
333 aa · LXL04_013573|LXL04_013573|OH1004|PROTEIN
MDRIKGPWSPDEDELLQQLVEKHGPRNWSLISKSIPGRSGKSCRLRWCNQLSPQVEHRAFTPEEDETILRAHARFGNKWATIARLLSGRTDNAIKNHWNSTLKRKCSSMTNEEFADFAIQQPSLKRSVSAGSAVAGSGLFFNPGSPTGSDISDSSVPPLSSPHVFRPVARPCPIVPPPIEVPKSCPQPPPPPPVNDPPTSLSLSLPGVESQTATPMQLMPPSPTLAAPPPSPVPIPATPLQQVPSNRSLEINLNNEAEFM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_013573 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_013573 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:31973425-31974426 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to MYB44: Transcription factor MYB44 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程 GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0010929 positive regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程 GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G39880 ath:AT3G09230 ath:AT3G50060 ath:AT4G37260 ath:AT5G67300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.892
细胞质0.246
线粒体0.022
细胞膜0.018
内质网0.009
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00249.38Myb_DNA-binding5-51 aaPF13921.13Myb_DNA-bind_68-66 aaPF00249.38Myb_DNA-binding59-101 aaPF13921.13Myb_DNA-bind_660-108 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_013573 | PF00249.38 | Myb_DNA-binding | 5 | 51 | 2.6e-39 | 133.8 |
| LXL04_013573 | PF13921.13 | Myb_DNA-bind_6 | 8 | 66 | 4.3e-29 | 101.2 |
| LXL04_013573 | PF00249.38 | Myb_DNA-binding | 59 | 101 | 2.6e-39 | 133.8 |
| LXL04_013573 | PF13921.13 | Myb_DNA-bind_6 | 60 | 108 | 4.3e-29 | 101.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FDW1 | 拟南芥 | Transcription factor MYB44 | 51.429% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O23160 | 拟南芥 | Transcription factor MYB73 | 47.853% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SN12 | 拟南芥 | Transcription factor MYB77 | 60.092% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q42575 | 拟南芥 | Transcription factor MYB1 | 48.235% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O04192 | 拟南芥 | Transcription factor MYB25 | 46.927% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |