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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_013538
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 31160145-31162604 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1176 bp · LXL04_013538|LXL04_013538|OH1004|cDNA

ATGATCATGGATACACCGATGGAGTGGGTGAGAGGTCAAGCAATAGGCCATGGAAGCTTCGCAGTTGTCAATTTGGCAAAACCAACAAGCCAGAGTTCACGTTTACCGCCATTGATGGCCGTCAAAACTTGTGGGGCATCTCAGTCTGATTCGTTAAAGAAAGAGTGTGTGATCTTGAATGAACTTAAGGATTGCCCGGAGATCATCACGTGTTACGGCGACAATATCACCACTGAAAACGGCGAGAGACTGTATAACGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1176 bp · LXL04_013538|LXL04_013538|OH1004|CDS

ATGATCATGGATACACCGATGGAGTGGGTGAGAGGTCAAGCAATAGGCCATGGAAGCTTCGCAGTTGTCAATTTGGCAAAACCAACAAGCCAGAGTTCACGTTTACCGCCATTGATGGCCGTCAAAACTTGTGGGGCATCTCAGTCTGATTCGTTAAAGAAAGAGTGTGTGATCTTGAATGAACTTAAGGATTGCCCGGAGATCATCACGTGTTACGGCGACAATATCACCACTGAAAACGGCGAGAGACTGTATAACGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

391 aa · LXL04_013538|LXL04_013538|OH1004|PROTEIN

MIMDTPMEWVRGQAIGHGSFAVVNLAKPTSQSSRLPPLMAVKTCGASQSDSLKKECVILNELKDCPEIITCYGDNITTENGERLYNVALEYASGGSLAERVKSSDNFGLPESDVRRYTNSVLKGLLFTHRSGFVHCDIKLQNILLFSGDGNGKDHVKIADFGLAKKAAEESNSKSKNEIRGTPMYMAPETVIAGEQGPASDIWAVGCLVLELLTGKPAWSCSDVAAVLMKIGVGAEIPDIPGKLSDAGKDFLGKCFVKDH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_013538
TK1151 IDTkA02G491290
OH-1004 IDLXL04_013538
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)74.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 63.939
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_013538
位置Chr03:31160145-31162604 (+)
描述Similar to MAPKKK20: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g50310 丝裂原活化蛋白激酶激酶 (MAPKK)，可磷酸化 MKK3 和 MPK18 并调控两个分别与根部微管功能相关的信号通路。
Arabidopsis MKKK20 is involved in osmotic stress response via regulation of MPK6 activity.2012 · DOI: 10.1007/s00299-011-1157-0
AIK1, A Mitogen-Activated Protein Kinase, Modulates Abscisic Acid Responses through the MKK5-MPK6 Kinase Cascade.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01386
The Arabidopsis Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 20 (MKKK20) Acts Upstream of MKK3 and MPK18 in Two Separate Signaling Pathways Involved in Root Microtubule Functions.2017 · DOI: 10.3389/fpls.2017.01352
At2g32510 脱落酸（ABA）信号通路的组成部分，在非生物胁迫情况下可能作为ABA信号转导子。 暂无已核实直接文献
At1g05100 脱落酸 信号通路的组成部分，在非生物胁迫下充当 ABA 信号转导器。
An abscisic acid inducible Arabidopsis MAPKKK, MAPKKK18 regulates leaf senescence via its kinase activity.2015 · DOI: 10.1007/s11103-015-0295-0
Arabidopsis ABA-Activated Kinase MAPKKK18 is Regulated by Protein Phosphatase 2C ABI1 and the Ubiquitin-Proteasome Pathway.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcv146
At1g63700 在 MAP 激酶级联反应中发挥作用，作为分子开关调节受精卵和早期胚胎的第一次细胞命运决定。 暂无已核实直接文献
At1g54960 通过调控MAP65-1等微管相关蛋白的磷酸化状态，参与皮层微管的组织和稳定。
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013538 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05100
ath:AT1G54960
ath:AT1G63700
ath:AT2G32510
ath:AT3G50310
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.696
排名 1 · LXL04_013538 · OH-1004
细胞质0.364
排名 2 · LXL04_013538 · OH-1004
细胞膜0.083
排名 3 · LXL04_013538 · OH-1004
内质网0.045
排名 4 · LXL04_013538 · OH-1004
质体0.026
排名 5 · LXL04_013538 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase11-275 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr12-270 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_013538PF00069.32Pkinase112752.2e-51175.5
LXL04_013538PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr122703.7e-30105.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SND6拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 2048.747%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O80888拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1738.182%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZVP5拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1840.071%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9CAD5拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA37.818%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FZ36拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 235.032%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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