基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_013221
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 26216882-26220256
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1728 bp · LXL04_013221|LXL04_013221|OH1004|cDNA
TCCCAACACCACTTACACATATTTTTCAGAGAGCCGGATCCCCGAATATGCCGTTTTGATATTGAAAAAGACCGAACCGAGAGAAGCTTAAAAGTGACGCAGAAAACCCCCTTCCTTTTTCTGTTTATTTCCCAACGACTCCGCTTCTGCTCCAGTTTAGATTTTCAGTCTACGATGCCGGAAGGGACGACATCCATAGATTACGTAATGGAGGCCGCCTCTGGTCCTCATTTCTCCGGCCTACATCTTGATGCACAATT...
CDS
下载 CDS FASTA1608 bp · LXL04_013221|LXL04_013221|OH1004|CDS
CTGTTTATTTCCCAACGACTCCGCTTCTGCTCCAGTTTAGATTTTCAGTCTACGATGCCGGAAGGGACGACATCCATAGATTACGTAATGGAGGCCGCCTCTGGTCCTCATTTCTCCGGCCTACATCTTGATGCACAATTCCTCTCTTCTCCAAGATCTCTTTCCTCCTCCCAGCTTGCCGACTCAATCAAACAGCCTTTCGTCATAGGGGTTTCTGGAGGTACTGCTTCCGGTAAGACGACGGTTTGTGATATGATTAT...
535 aa · LXL04_013221|LXL04_013221|OH1004|PROTEIN
MFISQRLRFCSSLDFQSTMPEGTTSIDYVMEAASGPHFSGLHLDAQFLSSPRSLSSSQLADSIKQPFVIGVSGGTASGKTTVCDMIIQQLHDHRVVLVNQLGFCSMRIDAALSHMRLMLGVQLRNRGSTTGSAFCTLVLSLCLTGILCISVPNQLDSFYRGLTAEESERAHEYNFDHPDAFDTEQMLECVEKLKGGNSVHLPIYDFKNHRRCSESFRQVNASDVIILEGILVFHDQRVRDLMNMKIFVDTDADVRLARRI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_013221 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_013221 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:26216882-26220256 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to UKL1: Uridine kinase-like protein 1, chloroplastic | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006207 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process 生物过程 GO:0044206 UMP salvage 生物过程 GO:0044211 CTP salvage 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:1901141 regulation of lignin biosynthetic process 生物过程 GO:2000904 regulation of starch metabolic process 生物过程 GO:2001006 regulation of cellulose biosynthetic process 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0004845 uracil phosphoribosyltransferase activity 分子功能 GO:0004849 uridine kinase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G55810 ath:AT3G27190 ath:AT3G27440 ath:AT4G26510 ath:AT5G40870 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.479
细胞核0.263
线粒体0.190
过氧化物酶体0.097
细胞膜0.066
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00485.25PRK153-302 aaPF14681.13UPRTase332-533 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_013221 | PF00485.25 | PRK | 153 | 302 | 1.2e-42 | 146.7 |
| LXL04_013221 | PF14681.13 | UPRTase | 332 | 533 | 9.6e-75 | 251.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FKS0 | 拟南芥 | Uridine/cytidine kinase UKL1, chloroplastic | 71.561% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9LK34 | 拟南芥 | Uridine/cytidine kinase UKL1, chloroplastic | 71.375% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O65583 | 拟南芥 | Uridine kinase-like protein 4 | 66.221% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8VYB2 | 拟南芥 | Uridine kinase-like protein 3 | 65.631% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9LTY6 | 拟南芥 | Uridine kinase-like protein 5 | 63.958% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |