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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_013133
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 24594131-24605139 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4350 bp · LXL04_013133|LXL04_013133|OH1004|cDNA

ATGGAATGTCAAAGGGTCATGTTGGCTCATGATGCCATAGGAAGTGTTAGAATGAATGCTATTAGATGGATTCTTGATGGATTTTCATTGAAGGCTGGAGATATGTTTGTTTTACTTTCTGTTCTTCATCACATCCACCATCCTATGGGTTACAAAATTCGAGTAGATGGTTCGATGTTTGGAGGAGCAAACCAAAAGGCTATCGATGATGAAGTTGCTAGGAAGAAGATCGAGTATGCGAACAATTTGGAACTTGTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

4350 bp · LXL04_013133|LXL04_013133|OH1004|CDS

ATGGAATGTCAAAGGGTCATGTTGGCTCATGATGCCATAGGAAGTGTTAGAATGAATGCTATTAGATGGATTCTTGATGGATTTTCATTGAAGGCTGGAGATATGTTTGTTTTACTTTCTGTTCTTCATCACATCCACCATCCTATGGGTTACAAAATTCGAGTAGATGGTTCGATGTTTGGAGGAGCAAACCAAAAGGCTATCGATGATGAAGTTGCTAGGAAGAAGATCGAGTATGCGAACAATTTGGAACTTGTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1449 aa · LXL04_013133|LXL04_013133|OH1004|PROTEIN

MECQRVMLAHDAIGSVRMNAIRWILDGFSLKAGDMFVLLSVLHHIHHPMGYKIRVDGSMFGGANQKAIDDEVARKKIEYANNLELVQVSKLYEMQKITFKIEIVAGPIPKNAVVEESKKIDATWVILDRRTKRDRKYFLEKLSCGVSRMKRNDDIVKVRGPKPPKTQSPRAPLSYGDMLPVDHKVSTREAQNDEDLFSIEFDSSHGSSTSTRTSTSESMPSIGNNQDDKIQLSTLLEAFGEERESSPEKTNANIVESPTT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_013133
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_013133
位置Chr03:24594131-24605139 (-)
描述Similar to TIC100: Protein TIC 100
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g22640 参与蛋白质前体输入叶绿体。
EMB1211 is required for normal embryo development and influences chloroplast biogenesis in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2010.01407.x
At1g70460 负向调控根毛伸长。 暂无已核实直接文献
At5g38560 可能参与根生长的负调控。
PERK-KIPK-KCBP signalling negatively regulates root growth in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1093/jxb/eru390
At1g26150 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At1g23540 在枝条分枝过程中调节生长素相关的 MAX（更多侧枝生长）途径。
Over-expression of the IGI1 leading to altered shoot-branching development related to MAX pathway in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1007/s11103-010-9645-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013133 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0032502 developmental process 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:1990641 response to iron ion starvation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23540
ath:AT1G26150
ath:AT1G70460
ath:AT5G22640
ath:AT5G38560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.414
排名 1 · LXL04_013133 · OH-1004
细胞质0.360
排名 2 · LXL04_013133 · OH-1004
细胞核0.297
排名 3 · LXL04_013133 · OH-1004
内质网0.064
排名 4 · LXL04_013133 · OH-1004
高尔基体0.053
排名 5 · LXL04_013133 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr307-553 aa
PF00069.32Pkinase323-553 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_013133PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3075533.1e-33115.9
LXL04_013133PF00069.32Pkinase3235532.5e-32113.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LPR8拟南芥Protein TIC 10066.047%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9CAL8拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1337.580%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FFW5拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK837.458%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C660拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1036.859%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9ZUE0拟南芥Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1236.909%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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