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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012905
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 20709448-20711954 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1545 bp · LXL04_012905|LXL04_012905|OH1004|cDNA

ATGATGGCACCGTTTCAAAACCTCATTAATCTGACAACAAAGTTCATCGACTCTAGGAAAGCTAACATGGGAACAAATAGTGTCAATTGGCATTCAGTTTTAGACAGCGACCAGTGGGTTGCCCTCCCAGTATCTGGCCAACGACCATCAGCCCGTTATAAGCATGCTGCAGTTATTGCTGATGAAAAGTTATACATTGTTGGTGGAAGTCGTAATGGGAGATACCTATCTGATGTTCAGGCATTTGATTTGAAGAACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1545 bp · LXL04_012905|LXL04_012905|OH1004|CDS

ATGATGGCACCGTTTCAAAACCTCATTAATCTGACAACAAAGTTCATCGACTCTAGGAAAGCTAACATGGGAACAAATAGTGTCAATTGGCATTCAGTTTTAGACAGCGACCAGTGGGTTGCCCTCCCAGTATCTGGCCAACGACCATCAGCCCGTTATAAGCATGCTGCAGTTATTGCTGATGAAAAGTTATACATTGTTGGTGGAAGTCGTAATGGGAGATACCTATCTGATGTTCAGGCATTTGATTTGAAGAACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

514 aa · LXL04_012905|LXL04_012905|OH1004|PROTEIN

MMAPFQNLINLTTKFIDSRKANMGTNSVNWHSVLDSDQWVALPVSGQRPSARYKHAAVIADEKLYIVGGSRNGRYLSDVQAFDLKNLTWSKVKLTTKSDTETDVFPSVSGHSMVKWGNKLIFLGGHSTDISDNVTVRFIDLESHLCGKMETTGKVPEARGGQSVSLVGSKLIMFGGEDKKRQLMNDVHVLDLNTFTWTVLETIQTPPSPRFDHTAAVHANRYLLIFGGCSHSMFFNDLHVLDLETLEWSNPQIQGDLVSP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012905
TK1151 IDTkA02G531170
OH-1004 IDLXL04_012905
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.200 / OH-1004 96.498
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012905
位置Chr03:20709448-20711954 (+)
描述Similar to ACBP4: Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05420 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins ACBP4 and ACBP5 are subcellularly localized to the cytosol and ACBP4 depletion affects membrane lipid composition.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9392-7
At5g27630 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0835600 以高亲和力结合中链和长链酰基辅酶 A 酯。
The rice acyl-CoA-binding protein gene family: phylogeny, expression and functional analysis.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03546.x
Subcellular localization of rice acyl-CoA-binding proteins (ACBPs) indicates that OsACBP6::GFP is targeted to the peroxisomes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12809
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012905 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0000062 fatty-acyl-CoA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05420
ath:AT5G27630
ddi:DDB_G0268860
dosa:Os03g0835600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.428
排名 1 · LXL04_012905 · OH-1004
细胞核0.234
排名 2 · LXL04_012905 · OH-1004
高尔基体0.146
排名 3 · LXL04_012905 · OH-1004
细胞膜0.113
排名 4 · LXL04_012905 · OH-1004
过氧化物酶体0.111
排名 5 · LXL04_012905 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13418.13Beta-prop_TYW430-200 aa
PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC734-96 aa
PF24981.2Beta-prop_ATRN-LZTR134-162 aa
PF13415.13Beta-prop_FBX4235-96 aa
PF13854.13Kelch_HCF36-228 aa
PF24996.1NANM38-133 aa
PF25210.2Kelch_FKB9549-104 aa
PF01344.32Kelch_151-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012905PF13418.13Beta-prop_TYW4302004.1e-1763.7
LXL04_012905PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC734961e-71241.5
LXL04_012905PF24981.2Beta-prop_ATRN-LZTR1341625.2e-42144.8
LXL04_012905PF13415.13Beta-prop_FBX4235966.1e-57193.3
LXL04_012905PF13854.13Kelch_HCF362284.4e-33115.7
LXL04_012905PF24996.1NANM381332.6e-1453.6
LXL04_012905PF25210.2Kelch_FKB95491043.8e-1660.2
LXL04_012905PF01344.32Kelch_151921.1e-30105.5
LXL04_012905PF07646.22Kelch_252931.1e-2485.7
LXL04_012905PF13854.13Kelch_HCF1032784.4e-33115.7
LXL04_012905PF13415.13Beta-prop_FBX421042316.1e-57193.3
LXL04_012905PF25210.2Kelch_FKB951092003.8e-1660.2
LXL04_012905PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC71103131e-71241.5
LXL04_012905PF24981.2Beta-prop_ATRN-LZTR11222015.2e-42144.8
LXL04_012905PF07646.22Kelch_21592001.1e-2485.7
LXL04_012905PF24981.2Beta-prop_ATRN-LZTR11853405.2e-42144.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MA55拟南芥Acyl-CoA-binding domain-containing protein 444.130%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8RWD9拟南芥Acyl-CoA-binding domain-containing protein 544.856%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q75LJ4水稻Acyl-CoA-binding domain-containing protein 644.650%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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