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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012003
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 4612081-4613508 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1428 bp · LXL04_012003|LXL04_012003|OH1004|cDNA

ATGGGTCTTGAAACATGGCTAATCAAGGTGAAGAAATCCATATCCCATAGCTTCGATTCCGTCCATGGTCACGGCCACCCACCAAATGGGAAACCGGTGATTAAGAAATCGAGGGTTGGAGTATTGGCTTTTGAGATCGGAGCAATCATGCCGAAGCTCAATTACATGTGGCAGATGCTCTCCGATAAGAATATTGCTCGTCTTCGCAATGAAACGGTGTGCCTGGAAGGTGTTCGGAAGATTGTCTCCCCCGACGATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1428 bp · LXL04_012003|LXL04_012003|OH1004|CDS

ATGGGTCTTGAAACATGGCTAATCAAGGTGAAGAAATCCATATCCCATAGCTTCGATTCCGTCCATGGTCACGGCCACCCACCAAATGGGAAACCGGTGATTAAGAAATCGAGGGTTGGAGTATTGGCTTTTGAGATCGGAGCAATCATGCCGAAGCTCAATTACATGTGGCAGATGCTCTCCGATAAGAATATTGCTCGTCTTCGCAATGAAACGGTGTGCCTGGAAGGTGTTCGGAAGATTGTCTCCCCCGACGATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

475 aa · LXL04_012003|LXL04_012003|OH1004|PROTEIN

MGLETWLIKVKKSISHSFDSVHGHGHPPNGKPVIKKSRVGVLAFEIGAIMPKLNYMWQMLSDKNIARLRNETVCLEGVRKIVSPDDVFLLGLACAEMVENLRVVAKSVARLSKRCEDPSLRSFETVFDGFANTGRDPYGWIMSWKEMEAKIKKMERYVTATVTLHREIDELTVIENALKKSSQCVNHKKDVSFTNTMKQQKILDLQQKLQWQKQEIRHLKEKSLWNRSFDTITSLLSKSIFTILARIKLVFNINHGYPYP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012003
TK1151 IDTkA02G593970
OH-1004 IDLXL04_012003
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012003
位置Chr03:4612081-4613508 (-)
描述Similar to PSI1: Protein PSK SIMULATOR 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g34320 可能通过调节植物硫因子 信号传导促进幼苗生长。
The PSI family of nuclear proteins is required for growth in arabidopsis.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0229-2
At5g08660 促进植物生长，尤其在营养生长期，可能通过调控植物硫激肽（PSK）信号；PSK是作为生长因子的肽类植物激素。
The PSI family of nuclear proteins is required for growth in arabidopsis.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0229-2
At1g30755 可能通过调节植物硫因子 信号传导促进幼苗生长。
The PSI family of nuclear proteins is required for growth in arabidopsis.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0229-2

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012003 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006109 regulation of carbohydrate metabolic process 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0043434 response to peptide hormone 生物过程
GO:0045927 positive regulation of growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003746 translation elongation factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30755
ath:AT1G34320
ath:AT5G08660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.513
排名 1 · LXL04_012003 · OH-1004
细胞核0.289
排名 2 · LXL04_012003 · OH-1004
细胞膜0.208
排名 3 · LXL04_012003 · OH-1004
高尔基体0.075
排名 4 · LXL04_012003 · OH-1004
线粒体0.069
排名 5 · LXL04_012003 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11961.14DUF347541-97 aa
PF05003.18DUF668320-407 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012003PF11961.14DUF347541972.2e-2176.4
LXL04_012003PF05003.18DUF6683204073.7e-31108.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XID5拟南芥Protein PSK SIMULATOR 126.218%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
P0DO24拟南芥Protein PSK SIMULATOR 322.986%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SA91拟南芥Protein PSK SIMULATOR 222.436%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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