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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_011777
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 43096-44064 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

603 bp · LXL04_011777|LXL04_011777|OH1004|cDNA

ATGACTTCAAGAAAGAAAAGCATGCTCGTTTGTGCGCTAGTAGGGATTCTAGGGTTTCTCTCTGCtgttttgagttttgttgcaGAGGCCAAGAGGATAAAGGGTTCGGAGGTTAGGTTTTCATCTCCATCTGAATGTGTGTACCCCCGGAGTCCAGCTCTAGCACTTGGATTAATGGCAGCTGTATGTCTGATGATTGCGCAAGTGATTATCAATGTTGCAACTGGTTGCATCTGTTGCAGAAAGTCATCAACCTCTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

603 bp · LXL04_011777|LXL04_011777|OH1004|CDS

ATGACTTCAAGAAAGAAAAGCATGCTCGTTTGTGCGCTAGTAGGGATTCTAGGGTTTCTCTCTGCTGTTTTGAGTTTTGTTGCAGAGGCCAAGAGGATAAAGGGTTCGGAGGTTAGGTTTTCATCTCCATCTGAATGTGTGTACCCCCGGAGTCCAGCTCTAGCACTTGGATTAATGGCAGCTGTATGTCTGATGATTGCGCAAGTGATTATCAATGTTGCAACTGGTTGCATCTGTTGCAGAAAGTCATCAACCTCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

200 aa · LXL04_011777|LXL04_011777|OH1004|PROTEIN

MTSRKKSMLVCALVGILGFLSAVLSFVAEAKRIKGSEVRFSSPSECVYPRSPALALGLMAAVCLMIAQVIINVATGCICCRKSSTSNWTLPILCFVLSWLTFVIAFLLLLTGAALNDEHGEENMYFGSYNCYVVKPGVFAGAASLSLASVVLGIMYYYSVSLAATKVLNGDGGAIVMGQPQQHDPVFVHEDTYARRQAYS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_011777
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_011777
位置Chr03:43096-44064 (-)
描述Similar to MWL1: Protein MODIFYING WALL LIGNIN-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31720 与 MWL2 一起，有助于次生细胞壁生物学，特别是木质素生物合成。
The Arabidopsis Domain of Unknown Function 1218 (DUF1218) Containing Proteins, MODIFYING WALL LIGNIN-1 and 2 (At1g31720/MWL-1 and At4g19370/MWL-2) Function Redundantly to Alter Secondary Cell Wall Lignin Content.2016 · DOI: 10.1371/journal.pone.0150254
At4g19370 与MWL1共同参与次生细胞壁生物学，特别是木质素生物合成。
The Arabidopsis Domain of Unknown Function 1218 (DUF1218) Containing Proteins, MODIFYING WALL LIGNIN-1 and 2 (At1g31720/MWL-1 and At4g19370/MWL-2) Function Redundantly to Alter Secondary Cell Wall Lignin Content.2016 · DOI: 10.1371/journal.pone.0150254
At2g32280 与 OPS 一起是胚胎原脉管系统发育和子叶维管复杂性和连接性所必需的。
Members of the DEAL subfamily of the DUF1218 gene family are required for bilateral symmetry but not for dorsoventrality in Arabidopsis leaves.2018 · DOI: 10.1111/nph.14898
At4g21310 参与，与 VCC/DEAL1 和 DEAL3 部分冗余，以确保双边对称发育和早期叶缘图案，可能通过生长素和 CUC2 分布的调节。
Members of the DEAL subfamily of the DUF1218 gene family are required for bilateral symmetry but not for dorsoventrality in Arabidopsis leaves.2018 · DOI: 10.1111/nph.14898

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011777 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009808 lignin metabolic process 生物过程
GO:0009809 lignin biosynthetic process 生物过程
GO:0009855 determination of bilateral symmetry 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0048825 cotyledon development 生物过程
GO:0140964 intracellular auxin homeostasis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31720
ath:AT2G32280
ath:AT4G19370
ath:AT4G21310
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.694
排名 1 · LXL04_011777 · OH-1004
溶酶体／液泡0.129
排名 2 · LXL04_011777 · OH-1004
内质网0.107
排名 3 · LXL04_011777 · OH-1004
细胞质0.107
排名 4 · LXL04_011777 · OH-1004
细胞核0.055
排名 5 · LXL04_011777 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06749.18DUF121860-150 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_011777PF06749.18DUF1218601504.7e-2898.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A2RVU1拟南芥Protein MODIFYING WALL LIGNIN-133.058%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O65708拟南芥Protein MODIFYING WALL LIGNIN-225.888%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9ZV57拟南芥Protein VASCULATURE COMPLEXITY AND CONNECTIVITY29.752%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
O81898拟南芥Protein DESIGUAL 223.729%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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