LXL04_011090 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_011090

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 157738233-157738676 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

300 bp · LXL04_011090|LXL04_011090|OH1004|cDNA

ATGATTATTTTTCTTCTTAACCCTCAAATCTCATATGGGGTTCCTGAGCTCTCGCAACAATATCTCGAATTTGCAAAGAAAAGTGAGGTTTATGATTGGATGGTGGGAGTTAGGAGAAAAATACATGAGAATCCAGAGCTGATGTACCAAGAATTTGAGACCAGTAAAGTTATTAGAGAAGAATTGGATAAATTGGGCCCGATTGCAGTTACCGGCGTTGTTGGATTCATCGGCTCCGGAGAACCTCCGTTTGTCGATCT...

CDS

下载 CDS FASTA

300 bp · LXL04_011090|LXL04_011090|OH1004|CDS

ATGATTATTTTTCTTCTTAACCCTCAAATCTCATATGGGGTTCCTGAGCTCTCGCAACAATATCTCGAATTTGCAAAGAAAAGTGAGGTTTATGATTGGATGGTGGGAGTTAGGAGAAAAATACATGAGAATCCAGAGCTGATGTACCAAGAATTTGAGACCAGTAAAGTTATTAGAGAAGAATTGGATAAATTGGGCCCGATTGCAGTTACCGGCGTTGTTGGATTCATCGGCTCCGGAGAACCTCCGTTTGTCGATCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

99 aa · LXL04_011090|LXL04_011090|OH1004|PROTEIN

MIIFLLNPQISYGVPELSQQYLEFAKKSEVYDWMVGVRRKIHENPELMYQEFETSKVIREELDKLGPIAVTGVVGFIGSGEPPFVDLSMQVHGEEGERR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_011090`
TK1151 ID	TkA02G105630
OH-1004 ID	LXL04_011090
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	98.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 83.636 / OH-1004 92.929 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_011090

位置 Chr02:157738233-157738676 (+)

描述 Similar to ILL4: IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g51760`	可能水解生长素与氨基酸的结合物。	IAR3 encodes an auxin conjugate hydrolase from Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.3.365 Characterization of a family of IAA-amino acid conjugate hydrolases from Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m111955200 A family of auxin-conjugate hydrolases that contributes to free indole-3-acetic acid levels during Arabidopsis germination.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.039677 The amidohydrolases IAR3 and ILL6 contribute to jasmonoyl-isoleucine hormone turnover and generate 12-hydroxyjasmonic acid upon wounding in Arabidopsis leaves.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.499228
`At5g56660`	水解植物生长调节剂吲哚-3-乙酸（IAA）的某些氨基酸结合物，包括 IAA-Ala、IAA-Leu、IAA-Met、IAA-Phe、IAA-Ser、IAA-Thr、IAA-Tyr 和 IAA-Val。	Characterization of a family of IAA-amino acid conjugate hydrolases from Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m111955200 A family of auxin-conjugate hydrolases that contributes to free indole-3-acetic acid levels during Arabidopsis germination.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.039677
`At1g51780`	水解植物生长调节剂吲哚-3-乙酸 (IAA) 的某些氨基酸缀合物。	暂无已核实直接文献
`At5g56650`	水解植物生长调节剂吲哚-3-乙酸（IAA）的某些氨基酸结合物，包括 IAA-Ala、IAA-Asn 和 IAA-Tyr。	Characterization of a family of IAA-amino acid conjugate hydrolases from Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m111955200

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q84XG9`	水解植物生长调节剂吲哚-3-乙酸 (IAA) 的某些氨基酸缀合物。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011090 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009850 auxin metabolic process 生物过程

GO:0010112 regulation of systemic acquired resistance 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005788 endoplasmic reticulum lumen 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0010178 IAA-amino acid conjugate hydrolase activity 分子功能

GO:0010179 IAA-Ala conjugate hydrolase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G51760

ath:AT1G51780

ath:AT5G56650

ath:AT5G56660

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.259

排名 1 · LXL04_011090 · OH-1004

细胞外0.248

排名 2 · LXL04_011090 · OH-1004

过氧化物酶体0.193

排名 3 · LXL04_011090 · OH-1004

线粒体0.120

排名 4 · LXL04_011090 · OH-1004

细胞核0.094

排名 5 · LXL04_011090 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O04373`	拟南芥	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 4	51.042%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`P54970`	拟南芥	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 2	57.647%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9SWX9`	拟南芥	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 5	52.083%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`P54969`	拟南芥	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 1	57.471%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q84XG9`	水稻	IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 1	59.155%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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