基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_010786
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 153467908-153472304
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2877 bp · LXL04_010786|LXL04_010786|OH1004|cDNA
ATGATTGAACCGATGGTACGATCAAAAATGCCGAATGTTAAACGCTGCAAATTGGAGGAAATTGACGCCGATACGACTGACAATTCGCATTCACATTACCCTTCTGTGGGTTTCACCAAGAAACAAAGAACAAACACCGCGTTCGTGGCAACTGCCGATAAGGAAGCCTGTTTTATCGACTACGAAAACGTCGTTAACGCTTGGTGCACTGGAGTTCCGTGTACCCCTGCCGATTTGAAGTCAAGTTCGAGTTCAATTAA...
CDS
下载 CDS FASTA2877 bp · LXL04_010786|LXL04_010786|OH1004|CDS
ATGATTGAACCGATGGTACGATCAAAAATGCCGAATGTTAAACGCTGCAAATTGGAGGAAATTGACGCCGATACGACTGACAATTCGCATTCACATTACCCTTCTGTGGGTTTCACCAAGAAACAAAGAACAAACACCGCGTTCGTGGCAACTGCCGATAAGGAAGCCTGTTTTATCGACTACGAAAACGTCGTTAACGCTTGGTGCACTGGAGTTCCGTGTACCCCTGCCGATTTGAAGTCAAGTTCGAGTTCAATTAA...
958 aa · LXL04_010786|LXL04_010786|OH1004|PROTEIN
MIEPMVRSKMPNVKRCKLEEIDADTTDNSHSHYPSVGFTKKQRTNTAFVATADKEACFIDYENVVNAWCTGVPCTPADLKSSSSSIKLLKSSRGRLSVCPSRFNDTVIGLWKKENDIDTNIRKRKFPFSDRESVSKKQSMEPKVGQMFSSSSSSATSFGNHISNDSKKARKTTKNVKRKESYTHQDFLTGEIVWAKCSNRFPAWPAIVIDAQQEAPTSVKKARIPNTVCVMFYGYSKRGTRDYAWVKDGMIYPFLEFLER...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_010786 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_010786 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:153467908-153472304 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ATX3: Histone-lysine N-methyltransferase ATX3 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程 GO:0032259 methylation 生物过程 GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程 GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程 GO:0000785 chromatin 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G05830 ath:AT3G61740 ath:AT4G27910 ath:AT5G53430 dosa:Os09g0134500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.898
细胞质0.154
细胞膜0.031
线粒体0.021
内质网0.013
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00855.24PWWP190-282 aaPF13831.13PHD_2542-576 aaPF13832.13zf-HC5HC2H_2583-695 aaPF13771.13zf-HC5HC2H605-696 aaPF00856.34SET827-933 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_010786 | PF00855.24 | PWWP | 190 | 282 | 4.4e-17 | 63.1 |
| LXL04_010786 | PF13831.13 | PHD_2 | 542 | 576 | 2.1e-13 | 50.2 |
| LXL04_010786 | PF13832.13 | zf-HC5HC2H_2 | 583 | 695 | 1e-28 | 100.4 |
| LXL04_010786 | PF13771.13 | zf-HC5HC2H | 605 | 696 | 3.8e-13 | 50.1 |
| LXL04_010786 | PF00856.34 | SET | 827 | 933 | 1.9e-25 | 90.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M364 | 拟南芥 | Histone-lysine N-methyltransferase ATX3 | 49.263% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8GZ42 | 拟南芥 | Histone-lysine N-methyltransferase ATX5 | 46.612% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SUE7 | 拟南芥 | Histone-lysine N-methyltransferase ATX4 | 48.394% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
P0CB22 | 拟南芥 | Histone-lysine N-methyltransferase ATX2 | 32.059% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q6K431 | 水稻 | Histone-lysine N-methyltransferase TRX1 | 34.115% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |