基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_010689
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 151675371-151681512
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1950 bp · LXL04_010689|LXL04_010689|OH1004|cDNA
ATGTCTGTGTGTAGATGTGCGGTGGTAACAGGGGCAAACAAAGGGATAGGATTTGAAATCTGCAAGCAATTAGCTTCAAATGGAGTCAAAGTAGTGTTGACTGCTAGAAACCAAAAAAGAGGGATTGACGCCATTGAAAAATTCAAAGGCACTCATCTTTCCGATCTTGTTATATTTCATCAACTTGATGTCATGGATCCCGCCAGCGTCGCCTCCTTGGCCCAATTTGTAAAAACCCAATTCGGAAAGCTTGATATCCT...
CDS
下载 CDS FASTA1950 bp · LXL04_010689|LXL04_010689|OH1004|CDS
ATGTCTGTGTGTAGATGTGCGGTGGTAACAGGGGCAAACAAAGGGATAGGATTTGAAATCTGCAAGCAATTAGCTTCAAATGGAGTCAAAGTAGTGTTGACTGCTAGAAACCAAAAAAGAGGGATTGACGCCATTGAAAAATTCAAAGGCACTCATCTTTCCGATCTTGTTATATTTCATCAACTTGATGTCATGGATCCCGCCAGCGTCGCCTCCTTGGCCCAATTTGTAAAAACCCAATTCGGAAAGCTTGATATCCT...
649 aa · LXL04_010689|LXL04_010689|OH1004|PROTEIN
MSVCRCAVVTGANKGIGFEICKQLASNGVKVVLTARNQKRGIDAIEKFKGTHLSDLVIFHQLDVMDPASVASLAQFVKTQFGKLDILVNNSGIGGVTRDEEALNNATGTQIDWNKILIQSHELAVQCLETNYYGAKRMVEHFIPLLESSNSPRIVNVSSSMGKLKDLKNEFAKGILSDVDNLTEEKIDQVLNGYLNDFKEGLLESKGWPNTLSAYMISKAAMNGYTRILAKKYTRFCINCVCPGFVKTDINYNRGILSTE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_010689 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_010689 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:151675371-151681512 (+) |
| 描述 | Similar to SDR1: (+)-neomenthol dehydrogenase |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0016104 triterpenoid biosynthetic process 生物过程 GO:0016135 saponin biosynthetic process 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0008106 alcohol dehydrogenase (NADP+) activity 分子功能 GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能 GO:0016616 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能 GO:0047501 (+)-neomenthol dehydrogenase activity 分子功能 GO:0047504 (-)-menthol dehydrogenase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G24190 ath:AT3G61220 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.676
细胞核0.221
线粒体0.145
过氧化物酶体0.084
细胞膜0.080
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00106.32adh_short6-164 aaPF01370.28Epimerase8-102 aaPF08659.17KR8-92 aaPF13561.13adh_short_C211-162 aaPF13561.13adh_short_C2205-252 aaPF00106.32adh_short211-252 aaPF00106.32adh_short335-493 aaPF01370.28Epimerase336-408 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_010689 | PF00106.32 | adh_short | 6 | 164 | 1.8e-70 | 237.2 |
| LXL04_010689 | PF01370.28 | Epimerase | 8 | 102 | 1.7e-12 | 48.0 |
| LXL04_010689 | PF08659.17 | KR | 8 | 92 | 2.3e-12 | 47.9 |
| LXL04_010689 | PF13561.13 | adh_short_C2 | 11 | 162 | 6.4e-53 | 180.5 |
| LXL04_010689 | PF13561.13 | adh_short_C2 | 205 | 252 | 6.4e-53 | 180.5 |
| LXL04_010689 | PF00106.32 | adh_short | 211 | 252 | 1.8e-70 | 237.2 |
| LXL04_010689 | PF00106.32 | adh_short | 335 | 493 | 1.8e-70 | 237.2 |
| LXL04_010689 | PF01370.28 | Epimerase | 336 | 408 | 1.7e-12 | 48.0 |
| LXL04_010689 | PF08659.17 | KR | 337 | 421 | 2.3e-12 | 47.9 |
| LXL04_010689 | PF13561.13 | adh_short_C2 | 340 | 491 | 6.4e-53 | 180.5 |
| LXL04_010689 | PF13561.13 | adh_short_C2 | 534 | 582 | 6.4e-53 | 180.5 |
| LXL04_010689 | PF00106.32 | adh_short | 540 | 581 | 1.8e-70 | 237.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。