LXL04_008688 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_008688

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 106227757-106230394 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2133 bp · LXL04_008688|LXL04_008688|OH1004|cDNA

ATGGACGAGTATAGACAAGCTCACATCCTACCAGCTGCATGGATGAACAAAAGTCCATCAGAACTAGCAGAATCAAATCTCTTCATAATCTCTTGTTTCACTGCTGGCCTTATTGGCATCCTTACAATCGTCTACACCGCCTTTCAATGGCGAAGAAACATCAGCCTAAGTTGGACAAAAGCCATTGCCGGCACAAAAAAAGATCCAAAATCAATAATCGATCTCGTGTCCCCTCACACCTGGCACTTGGAAGCCATAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2133 bp · LXL04_008688|LXL04_008688|OH1004|CDS

ATGGACGAGTATAGACAAGCTCACATCCTACCAGCTGCATGGATGAACAAAAGTCCATCAGAACTAGCAGAATCAAATCTCTTCATAATCTCTTGTTTCACTGCTGGCCTTATTGGCATCCTTACAATCGTCTACACCGCCTTTCAATGGCGAAGAAACATCAGCCTAAGTTGGACAAAAGCCATTGCCGGCACAAAAAAAGATCCAAAATCAATAATCGATCTCGTGTCCCCTCACACCTGGCACTTGGAAGCCATAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

710 aa · LXL04_008688|LXL04_008688|OH1004|PROTEIN

MDEYRQAHILPAAWMNKSPSELAESNLFIISCFTAGLIGILTIVYTAFQWRRNISLSWTKAIAGTKKDPKSIIDLVSPHTWHLEAIARGKSLNCCVCLKSMSPSQSLGPMVSSGSFIHRCSICGALAHLNCSPNAHKDCKCVSMVGSEHVLHQWAIRWTEVIDQPDGTSFCTHCEEPCSPSFLGGSPIWCCLWCQRLIHVDCHSSMYRETGDICDMGPFKRLILSPLYVKVVSHSHSQPSSGGILSSITYGANEIACSVR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_008688`
TK1151 ID	TkA03G344660
OH-1004 ID	LXL04_008688
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	94.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 92.922 / OH-1004 57.324 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_008688

位置 Chr02:106227757-106230394 (+)

描述 Similar to DGK1: Diacylglycerol kinase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g07920`	对第二信使二酰甘油（DAG）进行磷酸化生成磷脂酸（PA），另一种重要的信号分子。	暂无已核实直接文献
`At5g63770`	对第二信使二酰甘油（DAG）进行磷酸化生成磷脂酸（PA），另一种重要的信号分子。	AtDGK2, a novel diacylglycerol kinase from Arabidopsis thaliana, phosphorylates 1-stearoyl-2-arachidonoyl-sn-glycerol and 1,2-dioleoyl-sn-glycerol and exhibits cold-inducible gene expression.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m312187200 Arabidopsis AtDGK7, the smallest member of plant diacylglycerol kinases (DGKs), displays unique biochemical features and saturates at low substrate concentration: the DGK inhibitor R59022 differentially affects AtDGK2 and AtDGK7 activity in vitro and alters plant growth and development.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m506859200 DIACYLGLYCEROL ACYLTRANSFERASE and DIACYLGLYCEROL KINASE Modulate Triacylglycerol and Phosphatidic Acid Production in the Plant Response to Freezing Stress.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.00402

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008688 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006654 phosphatidic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007200 phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0046339 diacylglycerol metabolic process 生物过程

GO:0046473 phosphatidic acid metabolic process 生物过程

GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程

GO:0046834 lipid phosphorylation 生物过程

GO:0048364 root development 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G07920

ath:AT5G63770

hsa:1607

mmu:217480

rno:54248

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.304

排名 1 · LXL04_008688 · OH-1004

细胞膜0.247

排名 2 · LXL04_008688 · OH-1004

高尔基体0.235

排名 3 · LXL04_008688 · OH-1004

细胞质0.228

排名 4 · LXL04_008688 · OH-1004

细胞核0.138

排名 5 · LXL04_008688 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00130.29C1_1152-210 aa

PF00781.30DAGK_cat343-443 aa

PF00609.25DAGK_acc489-646 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_008688	`PF00130.29`	C1_1	152	210	1.3e-09	38.5
LXL04_008688	`PF00781.30`	DAGK_cat	343	443	5.2e-25	88.2
LXL04_008688	`PF00609.25`	DAGK_acc	489	646	2.8e-55	187.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39017`	拟南芥	Diacylglycerol kinase 1	67.527%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FFN7`	拟南芥	Diacylglycerol kinase 2	50.499%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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