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基因概览

LXL04_008316

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 96424424-96427683 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1598 bp · LXL04_008316|LXL04_008316|OH1004|cDNA

TGGTTCTGACCCGGTTTGGTGTTAAAGGAAAACTGCATCAAGAAGAAGCAATGACCGGTGGTGATGGAGATGTCAAAGCAGCTCCGGCGGGTCCGCCACCGCCGCTTGACTGGAAGTTCTCTCAGGTATTTGGTGAACGCACCGCCGgtgaagaagttcaagaagTTGATATCATTTCGGCTATAGAGTTTGATAAAAGCGGTGACCATCTTGCCACTGGTGATCGTGGTGGCAGGGTGGTATTATTCGAGAGGACTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1593 bp · LXL04_008316|LXL04_008316|OH1004|CDS

CTGACCCGGTTTGGTGTTAAAGGAAAACTGCATCAAGAAGAAGCAATGACCGGTGGTGATGGAGATGTCAAAGCAGCTCCGGCGGGTCCGCCACCGCCGCTTGACTGGAAGTTCTCTCAGGTATTTGGTGAACGCACCGCCGGTGAAGAAGTTCAAGAAGTTGATATCATTTCGGCTATAGAGTTTGATAAAAGCGGTGACCATCTTGCCACTGGTGATCGTGGTGGCAGGGTGGTATTATTCGAGAGGACTGATACAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

530 aa · LXL04_008316|LXL04_008316|OH1004|PROTEIN

MTRFGVKGKLHQEEAMTGGDGDVKAAPAGPPPPLDWKFSQVFGERTAGEEVQEVDIISAIEFDKSGDHLATGDRGGRVVLFERTDTKEHGGSRKDLEKTDYSSGRHPEFRYKTEFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWCQTANGAVFLLSTNDKTIKFWKVQEKKVKKIADMNMDVSKAIGNGNPASSSSYKSSHGVNGEYTDKSYTSLTKDLSIQSLRLPVVTSNETSLVARCRRVYAHAHDYHINSISNNSDAETFI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_008316`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_008316

位置 Chr02:96424424-96427683 (+)

描述 Similar to PP2AB2: Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g17720`	B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。	暂无已核实直接文献
`At1g51690`	B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0224200`	B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2X2K3`	B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。	暂无已核实直接文献
`Os06g0563300`	B调节亚基可能调节底物选择性和催化活性，也可能将催化酶定位到特定亚细胞区室。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008316 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006470 protein dephosphorylation 生物过程

GO:0000159 protein phosphatase type 2A complex 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0019888 protein phosphatase regulator activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G17720

ath:AT1G51690

dosa:Os02g0224200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.686

排名 1 · LXL04_008316 · OH-1004

细胞质0.303

排名 2 · LXL04_008316 · OH-1004

细胞膜0.068

排名 3 · LXL04_008316 · OH-1004

溶酶体／液泡0.061

排名 4 · LXL04_008316 · OH-1004

高尔基体0.047

排名 5 · LXL04_008316 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24814.2WD40_Prp19240-381 aa

PF25174.2Beta-prop_THOC3243-327 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_008316	`PF24814.2`	WD40_Prp19	240	381	1.1e-11	45.0
LXL04_008316	`PF25174.2`	Beta-prop_THOC3	243	327	1.7e-13	50.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39247`	拟南芥	Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform	81.165%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q38821`	拟南芥	Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform	78.143%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q0E2P1`	水稻	Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform	79.276%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`A2X2K3`	水稻	Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform	79.276%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q5Z8Z7`	水稻	Serine/threonine protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform	75.385%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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