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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_007062
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 34968648-34978505 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3813 bp · LXL04_007062|LXL04_007062|OH1004|cDNA

ATGACAACCACCGATCTCGCCACCATCTTACCTCGTGTGCTCATAGTATCTAGACGAAGCCTTCGCAAGAACAAGTTCGTTGATTTCGTCGGTGAATATCATCTAGATCTAATAGTCGGTTATGGAGCTGTCCCAGTGATTGTACCTCGAGTGACCGGAGTCAGCTTGCTACTCGAGAGCTTTGAGCCAATTCATGGAGTTCTTCTATGTGAAGGCGAAGACATCGATCCATCACTTTACGAAACGGAATCAACGATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

3813 bp · LXL04_007062|LXL04_007062|OH1004|CDS

ATGACAACCACCGATCTCGCCACCATCTTACCTCGTGTGCTCATAGTATCTAGACGAAGCCTTCGCAAGAACAAGTTCGTTGATTTCGTCGGTGAATATCATCTAGATCTAATAGTCGGTTATGGAGCTGTCCCAGTGATTGTACCTCGAGTGACCGGAGTCAGCTTGCTACTCGAGAGCTTTGAGCCAATTCATGGAGTTCTTCTATGTGAAGGCGAAGACATCGATCCATCACTTTACGAAACGGAATCAACGATTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1270 aa · LXL04_007062|LXL04_007062|OH1004|PROTEIN

MTTTDLATILPRVLIVSRRSLRKNKFVDFVGEYHLDLIVGYGAVPVIVPRVTGVSLLLESFEPIHGVLLCEGEDIDPSLYETESTILSPEELEEIRMLHSSDTAIDKEKDIIELSLAKLCLERNIPYLGICRGSQVLNVACGGTLYQDIEKELTKISSQPNKLVSHIDYDNYDGHRHMVEIVKNTPLHQWFKDSIEEEKMEIMVNSYHHQGVKRLAQRFKSMAFAPDGLIEGFYDPDSYNPEQGKFIMGLQFHPERMRRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_007062
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_007062
位置Chr02:34968648-34978505 (+)
描述Similar to GAT1_2.1: Putative glutamine amidotransferase GAT1_2.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15040 推测为谷氨酰胺胺转移酶，可以抑制芽分枝。
A nitrogen-regulated glutamine amidotransferase (GAT1_2.1) represses shoot branching in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.199364
At5g38210 叶锈病 10 抗性位点受体样蛋白激酶类似物 1.3。 暂无已核实直接文献
At1g18390 可能参与脱落酸 信号转导的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。
The AtLRK10L1.2, Arabidopsis ortholog of wheat LRK10, is involved in ABA-mediated signaling and drought resistance.2015 · DOI: 10.1007/s00299-014-1724-2
At1g66880 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 1.4。 暂无已核实直接文献
At1g25390 叶锈病 10 抗病位点受体样蛋白激酶样 1.1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007062 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:2000032 regulation of secondary shoot formation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016740 transferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15040
ath:AT1G18390
ath:AT1G66880
ath:AT5G38210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.734
排名 1 · LXL04_007062 · OH-1004
细胞质0.119
排名 2 · LXL04_007062 · OH-1004
内质网0.092
排名 3 · LXL04_007062 · OH-1004
细胞核0.082
排名 4 · LXL04_007062 · OH-1004
溶酶体／液泡0.051
排名 5 · LXL04_007062 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07722.20Peptidase_C2629-255 aa
PF00117.35GATase114-257 aa
PF13947.12GUB_WAK_bind433-497 aa
PF14380.12WAK_assoc567-630 aa
PF14380.12WAK_assoc761-830 aa
PF00069.32Pkinase938-1208 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr940-1210 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_007062PF07722.20Peptidase_C26292553.1e-42145.5
LXL04_007062PF00117.35GATase1142571.2e-1042.0
LXL04_007062PF13947.12GUB_WAK_bind4334975.2e-1556.3
LXL04_007062PF14380.12WAK_assoc5676307.3e-2794.8
LXL04_007062PF14380.12WAK_assoc7618307.3e-2794.8
LXL04_007062PF00069.32Pkinase93812081.9e-47162.6
LXL04_007062PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr94012102e-47162.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H0Z4拟南芥Putative glutamine amidotransferase GAT1_2.159.719%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8VYG0拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.346.006%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
P0C5E2拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.245.819%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4HQ17拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.447.245%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C6K9拟南芥LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.161.143%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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