基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_006904
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 29277900-29293461
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA5193 bp · LXL04_006904|LXL04_006904|OH1004|cDNA
ATGCTTCATCTTCCAATTTCACAGAAACGAAAGTTGACTGGAATTGTCAATGGACATCCGCTGCACAATAGCGACGAAACACAAGAACGAGTCAACAAACGAAATTCATCCATTCACTGTCGGAAGTCTGAAGCTATCAACGACACCGATTCATCTTCCTCTTCCTCCTCTGTACTACCAGACCAGACATGTCGACGTTTTACCTTTCCTGAAATTCAATCGGCAACCAATAATTTCGATGAGAATTTAGTGATTGGCCG...
CDS
下载 CDS FASTA5193 bp · LXL04_006904|LXL04_006904|OH1004|CDS
ATGCTTCATCTTCCAATTTCACAGAAACGAAAGTTGACTGGAATTGTCAATGGACATCCGCTGCACAATAGCGACGAAACACAAGAACGAGTCAACAAACGAAATTCATCCATTCACTGTCGGAAGTCTGAAGCTATCAACGACACCGATTCATCTTCCTCTTCCTCCTCTGTACTACCAGACCAGACATGTCGACGTTTTACCTTTCCTGAAATTCAATCGGCAACCAATAATTTCGATGAGAATTTAGTGATTGGCCG...
1730 aa · LXL04_006904|LXL04_006904|OH1004|PROTEIN
MLHLPISQKRKLTGIVNGHPLHNSDETQERVNKRNSSIHCRKSEAINDTDSSSSSSSVLPDQTCRRFTFPEIQSATNNFDENLVIGRGGFGNVYKCSTIGSAREVAVKRLHSMSNQGAHEFEAEVEVLSKLRHGNLVSLLGYCNEEKEMALIYEFMPNGTLEENLHRPELSLSWLQLLKISIGAARGLDYLHTGTSTQHGVIHRDVKSSNILLDANFDAKIADFGLARIGLIERTHVSTAVKGTFGYMDPSYFYTGKLTT...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_006904 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_006904 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:29277900-29293461 (-) |
| 描述 | Similar to CRK: CDPK-related protein kinase |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0010286 heat acclimation 生物过程 GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能 GO:0005516 calmodulin binding 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0046872 metal ion binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G41140 ath:AT3G50530 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.604
细胞核0.211
细胞膜0.201
溶酶体／液泡0.068
内质网0.061
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase83-344 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr84-347 aaPF00069.32Pkinase432-694 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr433-685 aaPF00069.32Pkinase922-1186 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr923-1188 aaPF00069.32Pkinase1271-1533 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr1272-1526 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_006904 | PF00069.32 | Pkinase | 83 | 344 | 1.5e-234 | 775.9 |
| LXL04_006904 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 84 | 347 | 2.9e-172 | 571.5 |
| LXL04_006904 | PF00069.32 | Pkinase | 432 | 694 | 1.5e-234 | 775.9 |
| LXL04_006904 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 433 | 685 | 2.9e-172 | 571.5 |
| LXL04_006904 | PF00069.32 | Pkinase | 922 | 1186 | 1.5e-234 | 775.9 |
| LXL04_006904 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 923 | 1188 | 2.9e-172 | 571.5 |
| LXL04_006904 | PF00069.32 | Pkinase | 1271 | 1533 | 1.5e-234 | 775.9 |
| LXL04_006904 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 1272 | 1526 | 2.9e-172 | 571.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。