基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_005573
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 168580774-168592708
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA8643 bp · LXL04_005573|LXL04_005573|OH1004|cDNA
ATGGCTGAAATCGTTGTTAGCGCCGTTATCAGCGTGCTGTGTGAAAAGCTGATCTCTGGAGACTTGCTGAAGTTGGCTCGATCAGAAGGGATCGACTCTCAGCTGCAGAAATTGAAGAAAAACTTGCCGCTGATCCAAGCGGTACTTGCTGATGCAAGCCAGAAGCACATAACAGACAGAGCTGTTCAATTGTGGGTGAAAGAGCTCCAGGAATTGGCTTATGACATAGAAGATGTACTTGATGATATGGCAACCGAAGC...
CDS
下载 CDS FASTA8643 bp · LXL04_005573|LXL04_005573|OH1004|CDS
ATGGCTGAAATCGTTGTTAGCGCCGTTATCAGCGTGCTGTGTGAAAAGCTGATCTCTGGAGACTTGCTGAAGTTGGCTCGATCAGAAGGGATCGACTCTCAGCTGCAGAAATTGAAGAAAAACTTGCCGCTGATCCAAGCGGTACTTGCTGATGCAAGCCAGAAGCACATAACAGACAGAGCTGTTCAATTGTGGGTGAAAGAGCTCCAGGAATTGGCTTATGACATAGAAGATGTACTTGATGATATGGCAACCGAAGC...
2880 aa · LXL04_005573|LXL04_005573|OH1004|PROTEIN
MAEIVVSAVISVLCEKLISGDLLKLARSEGIDSQLQKLKKNLPLIQAVLADASQKHITDRAVQLWVKELQELAYDIEDVLDDMATEAIRRKLTQEPSASTSNVTGKVLKLFPGCCTNFTPHNITYGRQMRSKLDEISNKLRDLVDQKNDLGLNVNVGRSNERERRQEETSLVDESKIMGREGDKEALLEKLLGNEECVGNVSIVSIVGMGGIGKTTLAKLLYNDQKVKDQFQLKAWVCVSEELDVFTVSKAIFQAVTGEN...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_005573 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_005573 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:168580774-168592708 (+) |
| 描述 | Similar to RPPL1: Putative disease resistance RPP13-like protein 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0098542 defense response to other organism 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0004016 adenylate cyclase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0043531 ADP binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G14460 ath:AT3G14470 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.476
细胞质0.309
细胞核0.176
内质网0.083
质体0.048
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF18052.7Rx_N5-94 aaPF00931.29NB-ARC181-351 aaPF23559.2WHD_DRP438-506 aaPF23598.2LRR_14580-914 aaPF25013.1LRR_Zer-1618-679 aaPF25019.1LRR_R13L1-DRL21710-836 aaPF23247.2LRR_RPS2921-995 aaPF23247.2LRR_RPS2927-1029 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_005573 | PF18052.7 | Rx_N | 5 | 94 | 2e-44 | 150.3 |
| LXL04_005573 | PF00931.29 | NB-ARC | 181 | 351 | 4e-75 | 251.9 |
| LXL04_005573 | PF23559.2 | WHD_DRP | 438 | 506 | 3.6e-50 | 168.6 |
| LXL04_005573 | PF23598.2 | LRR_14 | 580 | 914 | 1.7e-72 | 244.9 |
| LXL04_005573 | PF25013.1 | LRR_Zer-1 | 618 | 679 | 3.7e-13 | 50.5 |
| LXL04_005573 | PF25019.1 | LRR_R13L1-DRL21 | 710 | 836 | 6e-112 | 369.5 |
| LXL04_005573 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 921 | 995 | 2.4e-32 | 112.9 |
| LXL04_005573 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 927 | 1029 | 2.4e-32 | 112.9 |
| LXL04_005573 | PF23598.2 | LRR_14 | 1147 | 1379 | 1.7e-72 | 244.9 |
| LXL04_005573 | PF25019.1 | LRR_R13L1-DRL21 | 1199 | 1325 | 6e-112 | 369.5 |
| LXL04_005573 | PF23247.2 | LRR_RPS2 | 1416 | 1516 | 2.4e-32 | 112.9 |
| LXL04_005573 | PF18052.7 | Rx_N | 1945 | 2034 | 2e-44 | 150.3 |
| LXL04_005573 | PF00931.29 | NB-ARC | 2121 | 2291 | 4e-75 | 251.9 |
| LXL04_005573 | PF23559.2 | WHD_DRP | 2378 | 2447 | 3.6e-50 | 168.6 |
| LXL04_005573 | PF23598.2 | LRR_14 | 2516 | 2851 | 1.7e-72 | 244.9 |
| LXL04_005573 | PF25019.1 | LRR_R13L1-DRL21 | 2642 | 2768 | 6e-112 | 369.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。