基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_005318
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 160338157-160344602
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1965 bp · LXL04_005318|LXL04_005318|OH1004|cDNA
ATGGGGATTCTAAGCTTTTGTTTCTTGGTTTTCTCCTTACATAAACTCGTTGATGCTCAAATAGCCACTGAATCAAATGAAGTGACGGCTATTAAGAAACTTATAGATTATTGGGGTTTGAGTTCAAAGGTAAATTTGTCAGTTGACCCATGTACTACCGATGCGACTTGGGCTATGGAAAATGCAAATCCACGAATTGCTTGTGATTGTTCTAACGTCTGTCACATAACTCACTTGAAGATATGTGCTTTGGATATATC...
CDS
下载 CDS FASTA1965 bp · LXL04_005318|LXL04_005318|OH1004|CDS
ATGGGGATTCTAAGCTTTTGTTTCTTGGTTTTCTCCTTACATAAACTCGTTGATGCTCAAATAGCCACTGAATCAAATGAAGTGACGGCTATTAAGAAACTTATAGATTATTGGGGTTTGAGTTCAAAGGTAAATTTGTCAGTTGACCCATGTACTACCGATGCGACTTGGGCTATGGAAAATGCAAATCCACGAATTGCTTGTGATTGTTCTAACGTCTGTCACATAACTCACTTGAAGATATGTGCTTTGGATATATC...
654 aa · LXL04_005318|LXL04_005318|OH1004|PROTEIN
MGILSFCFLVFSLHKLVDAQIATESNEVTAIKKLIDYWGLSSKVNLSVDPCTTDATWAMENANPRIACDCSNVCHITHLKICALDISGELPQELFQLTELMDLNLGQNVLSGSIPREIGRLFKMQYLSLGINNFTGFVPAELGNLTKLKSLSFSSNGFNGPLPVDLGNLTSLEQLYIDSSGVSGPIPQELSNLKSLQTVWASDNGFTGKLPEFIGTFTKLKTLRLEGTALEGPIPNSYAALTQLEDLRIGDLGGEDSTLD...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_005318 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_005318 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:160338157-160344602 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At1g56130: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程 GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程 GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程 GO:0052542 defense response by callose deposition 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G07650 ath:AT1G53430 ath:AT1G56130 ath:AT1G56140 ath:AT3G14840 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.425
细胞外0.151
内质网0.137
溶酶体／液泡0.094
细胞质0.089
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF23598.2LRR_1467-179 aaPF23598.2LRR_14165-257 aaPF13855.13LRR_8268-326 aaPF12799.14LRR_4291-328 aaPF11721.15Malectin403-588 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_005318 | PF23598.2 | LRR_14 | 67 | 179 | 1.1e-22 | 81.0 |
| LXL04_005318 | PF23598.2 | LRR_14 | 165 | 257 | 1.1e-22 | 81.0 |
| LXL04_005318 | PF13855.13 | LRR_8 | 268 | 326 | 2e-18 | 66.6 |
| LXL04_005318 | PF12799.14 | LRR_4 | 291 | 328 | 5e-14 | 52.7 |
| LXL04_005318 | PF11721.15 | Malectin | 403 | 588 | 7.4e-40 | 137.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
C0LGH2 | 拟南芥 | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 | 42.587% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGH3 | 拟南芥 | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56140 | 41.838% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGE0 | 拟南芥 | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g07650 | 36.783% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGG8 | 拟南芥 | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430 | 33.974% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGN2 | 拟南芥 | Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 | 37.500% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |