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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_004450
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 136472516-136474350 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

790 bp · LXL04_004450|LXL04_004450|OH1004|cDNA

ATGGGTTTCCGGTCTAAATTTCCGCCACCGCTGCCGCCGTCCTCTTCAAAATTGATCACTTTCCTCGTCTGCATCATGCTGTTCCACACATACAACGGTCAAACTCTGCGAACTGATCCTTCCGAAGTAAGAGCGTTAAATACGATATTTGAACGATGGGATGTTCAAATCCCGAGGAACCTATGGAACATAAGCGGAGAACCATGCAGCGGAACAGCACTCGGACCAGATTTCGATGTGGATTACAACAATCCATCCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

675 bp · LXL04_004450|LXL04_004450|OH1004|CDS

ATGGGTTTCCGGTCTAAATTTCCGCCACCGCTGCCGCCGTCCTCTTCAAAATTGATCACTTTCCTCGTCTGCATCATGCTGTTCCACACATACAACGGTCAAACTCTGCGAACTGATCCTTCCGAAGTAAGAGCGTTAAATACGATATTTGAACGATGGGATGTTCAAATCCCGAGGAACCTATGGAACATAAGCGGAGAACCATGCAGCGGAACAGCACTCGGACCAGATTTCGATGTGGATTACAACAATCCATCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

224 aa · LXL04_004450|LXL04_004450|OH1004|PROTEIN

MGFRSKFPPPLPPSSSKLITFLVCIMLFHTYNGQTLRTDPSEVRALNTIFERWDVQIPRNLWNISGEPCSGTALGPDFDVDYNNPSIECNCTFDSNTTCHITKLKVSKLNRQGVIPQELAALTYLAVLKIDQNAFTGTLPPFLGNFSAMVVLSLAHNQFSGTVPKELGNLKQLNMLAISSNNFSGSLPPELGNLVNMQQFYLDSCGAGGEIPPTFANLQNLRVM

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_004450
TK1151 IDTkA01G147720
OH-1004 IDLXL04_004450
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.083 / OH-1004 46.429
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_004450
位置Chr01:136472516-136474350 (-)
描述Similar to At1g56130: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献
At3g14840 可能的富含亮氨酸重复（LRR）受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g14840。 暂无已核实直接文献
At1g29720 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g29720。 暂无已核实直接文献
At1g07650 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g07650。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004450 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0052542 defense response by callose deposition 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G56130
ath:AT1G56140
ath:AT3G14840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.785
排名 1 · LXL04_004450 · OH-1004
内质网0.086
排名 2 · LXL04_004450 · OH-1004
细胞质0.073
排名 3 · LXL04_004450 · OH-1004
细胞外0.046
排名 4 · LXL04_004450 · OH-1004
溶酶体／液泡0.038
排名 5 · LXL04_004450 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14104-179 aa
PF13855.13LRR_8124-183 aa
PF23598.2LRR_14141-222 aa
PF13855.13LRR_8151-205 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_004450PF23598.2LRR_141041791.8e-1247.4
LXL04_004450PF13855.13LRR_81241832.1e-0834.5
LXL04_004450PF23598.2LRR_141412221.8e-1247.4
LXL04_004450PF13855.13LRR_81512052.1e-0834.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGH2拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613046.698%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGH3拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614044.076%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGN2拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g1484035.238%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ASQ6拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g2972035.404%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGE0拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0765029.767%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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