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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_004227
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 130239522-130242104 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2583 bp · LXL04_004227|LXL04_004227|OH1004|cDNA

ATGGCCGCAGTAACCACACCACTGTCAATATTATCAATCTTCATCATACTTAATTCCCTTCCAATCCCATCATTTTCTTGTCCGATTCATCAAAAACAAGCTCTTCTTCGTTTCAAATCCACCATCACCACCATCTTCAATTCCAACACCGATCCCAACTCCGATGATTTCACTCCATACGAAGAACTAGATTCATGGAGTCCCAAATCCGATTGTTGTTCCTGGGCCCGCGTAAATTGCAGCACAACCAGAAAGAAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2583 bp · LXL04_004227|LXL04_004227|OH1004|CDS

ATGGCCGCAGTAACCACACCACTGTCAATATTATCAATCTTCATCATACTTAATTCCCTTCCAATCCCATCATTTTCTTGTCCGATTCATCAAAAACAAGCTCTTCTTCGTTTCAAATCCACCATCACCACCATCTTCAATTCCAACACCGATCCCAACTCCGATGATTTCACTCCATACGAAGAACTAGATTCATGGAGTCCCAAATCCGATTGTTGTTCCTGGGCCCGCGTAAATTGCAGCACAACCAGAAAGAAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

860 aa · LXL04_004227|LXL04_004227|OH1004|PROTEIN

MAAVTTPLSILSIFIILNSLPIPSFSCPIHQKQALLRFKSTITTIFNSNTDPNSDDFTPYEELDSWSPKSDCCSWARVNCSTTRKKTRIVTELHLGAVVPLFVDLVPVFSNVLNPLFEIRSLKLLDISMNSLVGEIPGDGFGNLTGLVHLDMMQNSFNGSIPGQLFRLPNLSYLDMSTNSLEGELGSELSSLRNLTTLTLSVNHFQGMIPPSLFKLESLRFLDLSNNSLTGGLSSEVGNLRNLESLKLNENFLTGTIPEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_004227
TK1151 IDTkA01G178110
OH-1004 IDLXL04_004227
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.385 / OH-1004 58.140
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_004227
位置Chr01:130239522-130242104 (+)
描述Similar to RLP46: Receptor-like protein 46
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g04220 类受体蛋白46。 暂无已核实直接文献
At3g05660 类受体蛋白33。 暂无已核实直接文献
At5g25910 对抗白粉病病原体所必需。 暂无已核实直接文献
At1g71400 参与CLV3及CLV3样肽的感知，这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。
Functional analyses of the CLAVATA2-like proteins and their domains that contribute to CLAVATA2 specificity.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.148197
At5g46330 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004227 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71400
ath:AT3G05660
ath:AT4G04220
ath:AT5G25910
ath:AT5G46330
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.838
排名 1 · LXL04_004227 · OH-1004
内质网0.088
排名 2 · LXL04_004227 · OH-1004
细胞质0.057
排名 3 · LXL04_004227 · OH-1004
细胞核0.037
排名 4 · LXL04_004227 · OH-1004
细胞外0.029
排名 5 · LXL04_004227 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13855.13LRR_8120-181 aa
PF13855.13LRR_8190-229 aa
PF23598.2LRR_14213-297 aa
PF12799.14LRR_4218-253 aa
PF12799.14LRR_4242-277 aa
PF12799.14LRR_4265-301 aa
PF13855.13LRR_8282-325 aa
PF23598.2LRR_14304-366 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_004227PF13855.13LRR_81201811.8e-54182.1
LXL04_004227PF13855.13LRR_81902291.8e-54182.1
LXL04_004227PF23598.2LRR_142132972.9e-44152.0
LXL04_004227PF12799.14LRR_42182531.7e-44149.5
LXL04_004227PF12799.14LRR_42422771.7e-44149.5
LXL04_004227PF12799.14LRR_42653011.7e-44149.5
LXL04_004227PF13855.13LRR_82823251.8e-54182.1
LXL04_004227PF23598.2LRR_143043662.9e-44152.0
LXL04_004227PF25013.1LRR_Zer-15716928.9e-1659.0
LXL04_004227PF13855.13LRR_85776361.8e-54182.1
LXL04_004227PF12799.14LRR_46016411.7e-44149.5
LXL04_004227PF23598.2LRR_147067922.9e-44152.0
LXL04_004227PF13855.13LRR_87147731.8e-54182.1
LXL04_004227PF12799.14LRR_47397741.7e-44149.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JGB6拟南芥Receptor-like protein 4644.549%Swiss-Prot中等数据库同源证据
F4J8G2拟南芥Receptor-like protein 3333.333%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7FZR1拟南芥Receptor-like protein 5233.098%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C9H7拟南芥Receptor-like protein 1233.018%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FL28拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS233.333%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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