基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_002795
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 58415606-58419541
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2469 bp · LXL04_002795|LXL04_002795|OH1004|cDNA
ATGGAACCGGCACCGGCATCGGAACCAGACATGATTTCTTTTAGTCGGGCCGGTTCCATAATTTTACAGTTTTCGGTTTCGGTTCCAGAGTCGGTTCAGTCCAGTTCGGGTCGATATTATCCATGCAAGATTAAAAAAGGTATGATCAGGGAGTTACTCTTTGGTTTCCTGTTGATTCATTCATCTCTAGCCAAACATGGACACCCCGGTAATCACAAACCTACAAGACGGACCCGGTTGCAAGCTATGCCTGCTATTGT...
CDS
下载 CDS FASTA2469 bp · LXL04_002795|LXL04_002795|OH1004|CDS
ATGGAACCGGCACCGGCATCGGAACCAGACATGATTTCTTTTAGTCGGGCCGGTTCCATAATTTTACAGTTTTCGGTTTCGGTTCCAGAGTCGGTTCAGTCCAGTTCGGGTCGATATTATCCATGCAAGATTAAAAAAGGTATGATCAGGGAGTTACTCTTTGGTTTCCTGTTGATTCATTCATCTCTAGCCAAACATGGACACCCCGGTAATCACAAACCTACAAGACGGACCCGGTTGCAAGCTATGCCTGCTATTGT...
822 aa · LXL04_002795|LXL04_002795|OH1004|PROTEIN
MEPAPASEPDMISFSRAGSIILQFSVSVPESVQSSSGRYYPCKIKKGMIRELLFGFLLIHSSLAKHGHPGNHKPTRRTRLQAMPAIVPGTGPAKKWLTLNGGEPLVIAQGGSPGLFPDSSVAGYTAGIAMGVIGTLKYCNLQLTKDNLGVCLANIKMDNCTNAAERFPKHQRRYSVNGRDIDGWFPLDFTIDQIMKEIRLIQNIYSRASVFDFVYPLVQPDSVWGMEPKGHLWLNVQNDAFFSSHQLNVIRYIEDSNKFF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_002795 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_002795 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:58415606-58419541 (-) |
| 描述 | Similar to GDPDL7: Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPDL7 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006071 glycerol metabolic process 生物过程 GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0006968 cellular defense response 生物过程 GO:0009932 cell tip growth 生物过程 GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G66980 ath:AT4G26690 ath:AT5G55480 ath:AT5G58050 ath:AT5G58170 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.475
细胞膜0.344
内质网0.088
细胞质0.079
高尔基体0.044
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03009.24GDPD427-715 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_002795 | PF03009.24 | GDPD | 427 | 715 | 3.4e-32 | 113.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LVN0 | 拟南芥 | Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPDL7 | 51.862% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9FGT9 | 拟南芥 | Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPDL6 | 52.594% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SZ11 | 拟南芥 | Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPDL3 | 40.689% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9FJ62 | 拟南芥 | Glycerophosphodiester phosphodiesterase GDPDL4 | 41.224% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
D7SFH9 | 拟南芥 | Protein SUPPRESSOR OF NPR1-1 CONSTITUTIVE 4 | 41.076% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |