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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_002643
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 53622120-53627500 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2664 bp · LXL04_002643|LXL04_002643|OH1004|cDNA

ATGGCGGAAATATTTGATAGTCACGCAAAGAGTGGAGGTTTTAGGGTTTCATTGTGCGGTGGCGCTCAGGAACTAGAACAGATGTCTAGAGACGGCAGTCAATACAGTCTCACCACTGCAATCTTACCTTCGCTCGGAGCTCGCAGCAACCGCCGTGTTAAACTTCGAAATTTCATTATATCTCCTTATGATCGCCGTTACAGGGCATGGGAGACATATCTAGTGGTTTTAGTCCTTTATACAGCATGGGCATCACCATT...

CDS

下载 CDS FASTA

2664 bp · LXL04_002643|LXL04_002643|OH1004|CDS

ATGGCGGAAATATTTGATAGTCACGCAAAGAGTGGAGGTTTTAGGGTTTCATTGTGCGGTGGCGCTCAGGAACTAGAACAGATGTCTAGAGACGGCAGTCAATACAGTCTCACCACTGCAATCTTACCTTCGCTCGGAGCTCGCAGCAACCGCCGTGTTAAACTTCGAAATTTCATTATATCTCCTTATGATCGCCGTTACAGGGCATGGGAGACATATCTAGTGGTTTTAGTCCTTTATACAGCATGGGCATCACCATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

887 aa · LXL04_002643|LXL04_002643|OH1004|PROTEIN

MAEIFDSHAKSGGFRVSLCGGAQELEQMSRDGSQYSLTTAILPSLGARSNRRVKLRNFIISPYDRRYRAWETYLVVLVLYTAWASPFEFGYLKRPRKPLSIIDNIVNGFFAIDIILTFFLAYLDKSTYLLVDDRKKIAWKYTSTWLAFDVISTIPSELVRKLSSRSFQAYGLFNMCRLWRLRRASALFARLEKDRNFNYFWVRCAKLIAVTLFAVHCAGCFYYYLAAHYPNPGKTWIGYGNEGFEKESLWIRYVTSMYWS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_002643
TK1151 IDTkA01G433710
OH-1004 IDLXL04_002643
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_002643
位置Chr01:53622120-53627500 (-)
描述Similar to AKT1: Potassium channel AKT1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26650 可能作为高选择性内向整流钾通道，介导低 K⁺ 条件下植物根部的钾吸收。
Regulated expression of Arabidopsis shaker K+ channel genes involved in K+ uptake and distribution in the plant.2003 · DOI: 10.1023/a:1022597102282
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
A Ca(2)+ signaling pathway regulates a K(+) channel for low-K response in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0605129103
A protein phosphorylation/dephosphorylation network regulates a plant potassium channel.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0707912104
High-affinity K(+) transport in Arabidopsis: AtHAK5 and AKT1 are vital for seedling establishment and postgermination growth under low-potassium conditions.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.154369
A role for the AKT1 potassium channel in plant nutrition.1998 · DOI: 10.1126/science.280.5365.918
At2g25600 高度选择性的内向整流钾通道，可能介导花粉膜中的钾摄取。
Pollen tube development and competitive ability are impaired by disruption of a Shaker K(+) channel in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1101/gad.213902
At4g32500 可能的钾通道。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: P0C550 高选择性内向整流钾通道，介导植物根部钾的吸收。 暂无已核实直接文献
Os01g0648000 高选择性内向整流钾通道，介导植物根部钾的吸收。
Rice K+ uptake channel OsAKT1 is sensitive to salt stress.2005 · DOI: 10.1007/s00425-004-1437-9
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002643 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:1990573 potassium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0034702 monoatomic ion channel complex 细胞组分
GO:0005242 inward rectifier potassium channel activity 分子功能
GO:0005249 voltage-gated potassium channel activity 分子功能
GO:0005267 potassium channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25600
ath:AT2G26650
ath:AT4G32500
dosa:Os01g0648000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.597
排名 1 · LXL04_002643 · OH-1004
细胞质0.173
排名 2 · LXL04_002643 · OH-1004
内质网0.135
排名 3 · LXL04_002643 · OH-1004
溶酶体／液泡0.103
排名 4 · LXL04_002643 · OH-1004
高尔基体0.083
排名 5 · LXL04_002643 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520.38Ion_trans67-312 aa
PF07885.23Ion_trans_2212-305 aa
PF00027.36cNMP_binding405-490 aa
PF12796.14Ank_2535-619 aa
PF13637.13Ank_4541-584 aa
PF13857.13Ank_5550-601 aa
PF00023.37Ank563-594 aa
PF13606.13Ank_3563-591 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_002643PF00520.38Ion_trans673121e-42146.7
LXL04_002643PF07885.23Ion_trans_22123052.5e-1350.4
LXL04_002643PF00027.36cNMP_binding4054901.4e-1557.7
LXL04_002643PF12796.14Ank_25356195e-32111.0
LXL04_002643PF13637.13Ank_45415844.7e-2484.6
LXL04_002643PF13857.13Ank_55506018.7e-2587.2
LXL04_002643PF00023.37Ank5635943.8e-2587.3
LXL04_002643PF13606.13Ank_35635915.1e-1657.7
LXL04_002643PF12796.14Ank_26347145e-32111.0
LXL04_002643PF13637.13Ank_46346814.7e-2484.6
LXL04_002643PF13857.13Ank_56537018.7e-2587.2
LXL04_002643PF00023.37Ank6606913.8e-2587.3
LXL04_002643PF11834.14KHA8128752.8e-2176.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38998拟南芥Potassium channel AKT166.782%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8GXE6拟南芥Potassium channel AKT661.208%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SCX5拟南芥Probable potassium channel AKT559.604%Swiss-Prot强数据库同源证据
P0C550水稻Potassium channel AKT162.342%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0JKV1水稻Potassium channel AKT162.227%Swiss-Prot强数据库同源证据

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