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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_002170
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 43046335-43048675 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1419 bp · LXL04_002170|LXL04_002170|OH1004|cDNA

ATGGGTTTGATAGAAGAGATAGCACCACCCTCTGTTTCAGTTTCAATTAGCTTAACAAGTCCCATATCCAAAAACCCAATAGATTTCAGCCGTATCACTCTTCTAACCGGAACCTGCAACCCATCAACAAGTGATTTGAACATTCTCGGAATAGGAAAATCCCCATTTTCAGAAAAATTCCAAGAATCTGGAACCAAACGTGATGATATCATGCTTCAAGACAAAAACCCAGGTGAAATTATGTCAATTGGGGACGCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1419 bp · LXL04_002170|LXL04_002170|OH1004|CDS

ATGGGTTTGATAGAAGAGATAGCACCACCCTCTGTTTCAGTTTCAATTAGCTTAACAAGTCCCATATCCAAAAACCCAATAGATTTCAGCCGTATCACTCTTCTAACCGGAACCTGCAACCCATCAACAAGTGATTTGAACATTCTCGGAATAGGAAAATCCCCATTTTCAGAAAAATTCCAAGAATCTGGAACCAAACGTGATGATATCATGCTTCAAGACAAAAACCCAGGTGAAATTATGTCAATTGGGGACGCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

472 aa · LXL04_002170|LXL04_002170|OH1004|PROTEIN

MGLIEEIAPPSVSVSISLTSPISKNPIDFSRITLLTGTCNPSTSDLNILGIGKSPFSEKFQESGTKRDDIMLQDKNPGEIMSIGDANSINLPITVAIKGIDKGQIVAEVISVRKETIENAIGHTLKASMMVLADKNHRKSVRSVFELECVPLYGSHSVCGKRPEMEDAVATVPQFMKIPVRMLAGNRVLNGMNLNLNDLTAHFFGVYDGHGGFEVANYCCDRLHIALEEEIKVMKQELIKGTMNDTVRIHWEKAFTNCFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_002170
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_002170
位置Chr01:43046335-43048675 (+)
描述Similar to HAB1: Protein phosphatase 2C 16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g72770 脱落酸（ABA）信号通路的关键组成部分和抑制因子，调节多种ABA反应，如气孔关闭、种子萌发和营养生长抑制。
Gain-of-function and loss-of-function phenotypes of the protein phosphatase 2C HAB1 reveal its role as a negative regulator of abscisic acid signalling.2004 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01966.x
Enhancement of abscisic acid sensitivity and reduction of water consumption in Arabidopsis by combined inactivation of the protein phosphatases type 2C ABI1 and HAB1.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081018
A hypermorphic mutation in the protein phosphatase 2C HAB1 strongly affects ABA signaling in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.07.047
At1g17550 脱落酸（ABA）信号通路的关键组成部分和抑制因子，调节多种ABA反应，如气孔关闭、种子萌发和营养生长抑制。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0583100 可能的蛋白磷酸酶，可能在脱落酸（ABA）信号中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0592800 蛋白磷酸酶，作为脱落酸(ABA)信号的负调控因子。
ABA Regulates Subcellular Redistribution of OsABI-LIKE2, a Negative Regulator in ABA Signaling, to Control Root Architecture and Drought Resistance in Oryza sativa.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcv154
Os05g0537400 参与脱落酸(ABA)信号的蛋白磷酸酶。
Modulation of ABA Signaling by Altering VxGΦL Motif of PP2Cs in Oryza sativa.2017 · DOI: 10.1016/j.molp.2017.08.003
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002170 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:1902531 regulation of intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004722 protein serine/threonine phosphatase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17550
ath:AT1G72770
dosa:Os01g0583100
dosa:Os05g0537400
dosa:Os05g0592800
osa:4339797
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.459
排名 1 · LXL04_002170 · OH-1004
细胞质0.408
排名 2 · LXL04_002170 · OH-1004
细胞膜0.177
排名 3 · LXL04_002170 · OH-1004
内质网0.052
排名 4 · LXL04_002170 · OH-1004
质体0.049
排名 5 · LXL04_002170 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00481.27PP2C189-455 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_002170PF00481.27PP2C1894551.1e-62212.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAJ0拟南芥Protein phosphatase 2C 1654.911%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LNP9拟南芥Protein phosphatase 2C 756.208%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0JLP9水稻Probable protein phosphatase 2C 663.793%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6L4R7水稻Protein phosphatase 2C 5361.652%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6L5H6水稻Protein phosphatase 2C 5060.534%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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