基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_002118
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 42078641-42082387
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2526 bp · LXL04_002118|LXL04_002118|OH1004|cDNA
ATGATGGCGATGTCATGCAAGGATGGTAAGGGTGCAATAATGGATAATGGCAAGTATGTTCGATACACACCTGAGCAGGTTGAAGCTCTTGAAAGGCTATACCATGAGTGCCCAAAACCGAGTTCCATTCGTCGTCAACAACTCATTCGCGAATGCCCTATTCTCTCCAACATTGAACCCAAACAGATCAAAGTTTGGTTCCAAAATCgaagATGCAGAGAGAAACAAAGGAAAGAGGCTTCCCGTCTTCAGTCTGTGAA...
CDS
下载 CDS FASTA2526 bp · LXL04_002118|LXL04_002118|OH1004|CDS
ATGATGGCGATGTCATGCAAGGATGGTAAGGGTGCAATAATGGATAATGGCAAGTATGTTCGATACACACCTGAGCAGGTTGAAGCTCTTGAAAGGCTATACCATGAGTGCCCAAAACCGAGTTCCATTCGTCGTCAACAACTCATTCGCGAATGCCCTATTCTCTCCAACATTGAACCCAAACAGATCAAAGTTTGGTTCCAAAATCGAAGATGCAGAGAGAAACAAAGGAAAGAGGCTTCCCGTCTTCAGTCTGTGAA...
841 aa · LXL04_002118|LXL04_002118|OH1004|PROTEIN
MMAMSCKDGKGAIMDNGKYVRYTPEQVEALERLYHECPKPSSIRRQQLIRECPILSNIEPKQIKVWFQNRRCREKQRKEASRLQSVNRKLTAMNKLLMEENDRLQKQVSHLVYENGCFRQHTQNTTVASKDTSCDSVVSSGQRHLTPQHPPRDASPAGLLSIAEETLTEFLSKATGTAVEWVQMPGMKPGPDSIGIVAISHGCTGVAARACGLVGLEPTRVAEILKDRTSWFRDCRAVDVYDVLPTANGGTIELLYMQLY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_002118 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_002118 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:42078641-42082387 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to ATHB-15: Homeobox-leucine zipper protein ATHB-15 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程 GO:0009733 response to auxin 生物过程 GO:0009855 determination of bilateral symmetry 生物过程 GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程 GO:0010014 meristem initiation 生物过程 GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程 GO:0010072 primary shoot apical meristem specification 生物过程 GO:0010073 meristem maintenance 生物过程 GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程 GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程 GO:0010089 xylem development 生物过程 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G52150 ath:AT4G32880 dosa:Os03g0640800 dosa:Os12g0612700 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.605
细胞质0.327
细胞膜0.103
内质网0.058
质体0.040
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00046.36Homeodomain18-76 aaPF01852.26START162-369 aaPF08670.18MEKHLA698-840 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_002118 | PF00046.36 | Homeodomain | 18 | 76 | 7.1e-16 | 58.5 |
| LXL04_002118 | PF01852.26 | START | 162 | 369 | 1.5e-50 | 172.2 |
| LXL04_002118 | PF08670.18 | MEKHLA | 698 | 840 | 6.2e-47 | 159.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9ZU11 | 拟南芥 | Homeobox-leucine zipper protein ATHB-15 | 81.094% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q39123 | 拟南芥 | Homeobox-leucine zipper protein ATHB-8 | 76.655% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q6AST1 | 水稻 | Homeobox-leucine zipper protein HOX32 | 70.131% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
A2XK30 | 水稻 | Homeobox-leucine zipper protein HOX32 | 70.131% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q2QM96 | 水稻 | Homeobox-leucine zipper protein HOX33 | 68.149% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |