基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_001843
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 34892129-34899228
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3486 bp · LXL04_001843|LXL04_001843|OH1004|cDNA
ATGAGCATCGTACCACAAGAGACAGTTGAGGTCATAGCACAAAGCATCGGCATAAATAATTTATCTCCAGATGCTGCATTAGCTCTTGCTCCTGATGTAGAATACCGAATGCGGGAAATAATGCAGGAAGCAATCAAATGCATGCACCATTCAAAAAGAACCACATTGACCACAGATGATGTAGACAGTGCACTCACCATGAGAAACGTTGAGCCAATCTATGGATTCACATCTGGAGACCCATTACGGTTCAAAAAAGC...
CDS
下载 CDS FASTA3486 bp · LXL04_001843|LXL04_001843|OH1004|CDS
ATGAGCATCGTACCACAAGAGACAGTTGAGGTCATAGCACAAAGCATCGGCATAAATAATTTATCTCCAGATGCTGCATTAGCTCTTGCTCCTGATGTAGAATACCGAATGCGGGAAATAATGCAGGAAGCAATCAAATGCATGCACCATTCAAAAAGAACCACATTGACCACAGATGATGTAGACAGTGCACTCACCATGAGAAACGTTGAGCCAATCTATGGATTCACATCTGGAGACCCATTACGGTTCAAAAAAGC...
1161 aa · LXL04_001843|LXL04_001843|OH1004|PROTEIN
MSIVPQETVEVIAQSIGINNLSPDAALALAPDVEYRMREIMQEAIKCMHHSKRTTLTTDDVDSALTMRNVEPIYGFTSGDPLRFKKALGHKDLFYIDDKDVDFKDVIEAPLPKAPLDTSIFCHWLAIEGVQPAIPENAPVEVITVLPDSKKPEQKSNELPVDIRLPVKHVLSRELQLYFNKITELAVNMPDTVLFKEALMSLATDSGLHPLVPYFTCFIEDEVSRGLNDFHLLFALMRLVSSLLQNPHIHVEPYLHQLMP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_001843 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G504320 |
| OH-1004 ID | LXL04_001843 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 98.200 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 96.784 / OH-1004 28.252覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_001843 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:34892129-34899228 (+) |
| 描述 | Similar to TAF6: Transcription initiation factor TFIID subunit 6 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006282 regulation of DNA repair 生物过程 GO:0006352 DNA-templated transcription initiation 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006366 transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter 生物过程 GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程 GO:0009860 pollen tube growth 生物过程 GO:0042789 mRNA transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0045786 negative regulation of cell cycle 生物过程 GO:0045815 transcription initiation-coupled chromatin remodeling 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0051123 RNA polymerase II preinitiation complex assembly 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G04950 ath:AT1G54360 hsa:6878 spo:2539133 xla:397724 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.946
细胞质0.103
细胞膜0.027
内质网0.015
质体0.012
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF02969.24TAF1-65 aaPF00125.31Histone21-65 aaPF07571.20TAF6_C167-349 aaPF13837.13Myb_DNA-bind_4906-978 aaPF14303.13NAM-associated1011-1141 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_001843 | PF02969.24 | TAF | 1 | 65 | 1.5e-31 | 109.0 |
| LXL04_001843 | PF00125.31 | Histone | 21 | 65 | 2e-06 | 28.8 |
| LXL04_001843 | PF07571.20 | TAF6_C | 167 | 349 | 1.3e-70 | 237.6 |
| LXL04_001843 | PF13837.13 | Myb_DNA-bind_4 | 906 | 978 | 9.9e-07 | 29.8 |
| LXL04_001843 | PF14303.13 | NAM-associated | 1011 | 1141 | 8.5e-06 | 27.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。