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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_001783
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 33326553-33330292 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3354 bp · LXL04_001783|LXL04_001783|OH1004|cDNA

ATGAGGAATCTAGATTTTGAAAAACATTTTTTCCCCTTGTTGCTACTCATGTTATCGATCACTGTCCTTGTTGATTCAATAAACGAAGAAGGTGCTGTCCTTTTGGAGTTCAGATTCTCTCTTTCTGACCCAAATAACAATCTCCGTACATGGAATAATCAATCCGATTCATTTCCTTGTAATTGGATTGGTATAAACTGTACCATTGATCACAAGGTAACGTCTATAAACCTCAGTAACCTTAATCTATCCGGCTCTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

3354 bp · LXL04_001783|LXL04_001783|OH1004|CDS

ATGAGGAATCTAGATTTTGAAAAACATTTTTTCCCCTTGTTGCTACTCATGTTATCGATCACTGTCCTTGTTGATTCAATAAACGAAGAAGGTGCTGTCCTTTTGGAGTTCAGATTCTCTCTTTCTGACCCAAATAACAATCTCCGTACATGGAATAATCAATCCGATTCATTTCCTTGTAATTGGATTGGTATAAACTGTACCATTGATCACAAGGTAACGTCTATAAACCTCAGTAACCTTAATCTATCCGGCTCTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1117 aa · LXL04_001783|LXL04_001783|OH1004|PROTEIN

MRNLDFEKHFFPLLLLMLSITVLVDSINEEGAVLLEFRFSLSDPNNNLRTWNNQSDSFPCNWIGINCTIDHKVTSINLSNLNLSGSLSPTICKLPFLTDFNISKNFISGPIPNLSSCQHLEVVDLCTNRFHDDFPSQISTVSTLRVLSLCENYISGVIPEDIQNLASLEELVVYSNNLTGSIPKSIGRLKKLRIIRAGVNSLSGPIPSEISECENLEVLGLAQNNLEGPIPKELQNLEHLTSLVLWQNVLSGEIPPEIGN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_001783
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_001783
位置Chr01:33326553-33330292 (-)
描述Similar to At1g17230: Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g17230
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At2g33170 推测的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶At2g33170。 暂无已核实直接文献
At1g34110 与 RGI1、RGI2、RGI3 和 RGI4 一起，作为 RGF1 的受体，RGF1 是一种通过调节转录因子 PLETHORA (PLT) 的表达水平和模式来维持胚后根干细胞区的肽激素。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63
At5g48940 与RGI1、RGI3、RGI4和RGI5一起，作为RGF肽（例如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN）的受体，这些肽激素通过调控转录因子PLETHORA（PLT，例如PLT1和PLT2）的表达水平和模式，维持胚后根干细胞利基。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001783 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010074 maintenance of meristem identity 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010449 root meristem growth 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0001653 peptide receptor activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0038023 signaling receptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G34110
ath:AT2G33170
ath:AT5G48940
ath:AT5G63930
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.862
排名 1 · LXL04_001783 · OH-1004
内质网0.086
排名 2 · LXL04_001783 · OH-1004
细胞质0.062
排名 3 · LXL04_001783 · OH-1004
细胞核0.035
排名 4 · LXL04_001783 · OH-1004
溶酶体／液泡0.031
排名 5 · LXL04_001783 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_228-68 aa
PF23598.2LRR_14111-244 aa
PF13855.13LRR_8119-178 aa
PF23598.2LRR_14209-342 aa
PF13855.13LRR_8263-322 aa
PF23598.2LRR_14472-554 aa
PF13855.13LRR_8500-557 aa
PF23598.2LRR_14543-651 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_001783PF08263.18LRRNT_228682.8e-1041.0
LXL04_001783PF23598.2LRR_141112441.9e-44152.6
LXL04_001783PF13855.13LRR_81191782.8e-36123.8
LXL04_001783PF23598.2LRR_142093421.9e-44152.6
LXL04_001783PF13855.13LRR_82633222.8e-36123.8
LXL04_001783PF23598.2LRR_144725541.9e-44152.6
LXL04_001783PF13855.13LRR_85005572.8e-36123.8
LXL04_001783PF23598.2LRR_145436511.9e-44152.6
LXL04_001783PF00069.32Pkinase80510789.6e-45153.7
LXL04_001783PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr80810241.8e-40139.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SHI2拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723062.881%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LVP0拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393051.974%Swiss-Prot强数据库同源证据
O49318拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g3317051.300%Swiss-Prot强数据库同源证据
C0LGF5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI540.292%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGV1拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI238.919%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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