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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_000992
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 17947910-17954069 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2388 bp · LXL04_000992|LXL04_000992|OH1004|cDNA

ATGTCATCAAACACATCAAGCACATCAAGTACAAATTCTGAAGAAGAGACATTGATCGATTACGCTGCAGAGGTAGCTGTTAATTTGGCTAATACGTTATCACAAGGAGAAGGGAGCAATGCTATTCGAAGAAATAGACGACATATCACAAGGGGACGGGATCAAGGGCAAAATCGTCTGATGGAATATTATTTTAACGATAATGCTATCTATCAGGTTTACTTTCGGAGGCGGTTCAGaatgcataaacctttgttTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2388 bp · LXL04_000992|LXL04_000992|OH1004|CDS

ATGTCATCAAACACATCAAGCACATCAAGTACAAATTCTGAAGAAGAGACATTGATCGATTACGCTGCAGAGGTAGCTGTTAATTTGGCTAATACGTTATCACAAGGAGAAGGGAGCAATGCTATTCGAAGAAATAGACGACATATCACAAGGGGACGGGATCAAGGGCAAAATCGTCTGATGGAATATTATTTTAACGATAATGCTATCTATCAGGTTTACTTTCGGAGGCGGTTCAGAATGCATAAACCTTTGTTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

795 aa · LXL04_000992|LXL04_000992|OH1004|PROTEIN

MSSNTSSTSSTNSEEETLIDYAAEVAVNLANTLSQGEGSNAIRRNRRHITRGRDQGQNRLMEYYFNDNAIYQVYFRRRFRMHKPLFFRIVEGVCSVCESFTQRPDARGTFGFTPIQKCTAALRMLAYGTHPDSLDENFRMSERTARDTLIHFCDSILQLYAPRYLRYPTPNDVKQLYDHHANVHGSMSKTLWWIAFFLISVWLSSSRVFAIDNFNQAFPIVEPDPGHTKLRLSTEGLEAIRRITNPIAAVAVIGPYRSGK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_000992
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_000992
位置Chr01:17947910-17954069 (-)
描述Similar to GBP7: Guanylate-binding protein 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000992 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001818 negative regulation of cytokine production 生物过程
GO:0002218 activation of innate immune response 生物过程
GO:0006605 protein targeting 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0032480 negative regulation of type I interferon production 生物过程
GO:0032731 positive regulation of interleukin-1 beta production 生物过程
GO:0032741 positive regulation of interleukin-18 production 生物过程
GO:0034067 protein localization to Golgi apparatus 生物过程
GO:0034345 negative regulation of type III interferon production 生物过程
GO:0035458 cellular response to interferon-beta 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0042832 defense response to protozoan 生物过程
KEGG 基因交叉引用
hsa:115361
hsa:115362
hsa:388646
mmu:229900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.565
排名 1 · LXL04_000992 · OH-1004
高尔基体0.191
排名 2 · LXL04_000992 · OH-1004
细胞核0.146
排名 3 · LXL04_000992 · OH-1004
细胞质0.094
排名 4 · LXL04_000992 · OH-1004
细胞膜0.070
排名 5 · LXL04_000992 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28509.1DUF841856-93 aa
PF02263.26GBP229-477 aa
PF02841.21GBP_C488-617 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_000992PF28509.1DUF841856931e-1248.3
LXL04_000992PF02263.26GBP2294779.8e-36124.0
LXL04_000992PF02841.21GBP_C4886176.7e-1039.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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