基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000404
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 7483663-7492864
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4014 bp · LXL04_000404|LXL04_000404|OH1004|cDNA
ATGATTCCCGTCAAATTTCATCTCTTCTTCTGTGTTTCTTTAATCTGTTTTTCTGTTTCTTCTTCATTGAACTCCGATGGGCTTTCACTGCTGGCACTCAAGGCCGCCGTCACCGGTGATCCTAGTAACTCCCTCGCCACCTGGAGGGAGACAGATTCAACGCCGTGCCGCTGGACTGGCGTCGCCTGCAACTCCGACCACCGTGTCACTAGCATTTTTCTACCCAATAAGAATCTCACTGGCTACCTTCCATCGGAGCT...
CDS
下载 CDS FASTA3738 bp · LXL04_000404|LXL04_000404|OH1004|CDS
ATGATTCCCGTCAAATTTCATCTCTTCTTCTGTGTTTCTTTAATCTGTTTTTCTGTTTCTTCTTCATTGAACTCCGATGGGCTTTCACTGCTGGCACTCAAGGCCGCCGTCACCGGTGATCCTAGTAACTCCCTCGCCACCTGGAGGGAGACAGATTCAACGCCGTGCCGCTGGACTGGCGTCGCCTGCAACTCCGACCACCGTGTCACTAGCATTTTTCTACCCAATAAGAATCTCACTGGCTACCTTCCATCGGAGCT...
1245 aa · LXL04_000404|LXL04_000404|OH1004|PROTEIN
MIPVKFHLFFCVSLICFSVSSSLNSDGLSLLALKAAVTGDPSNSLATWRETDSTPCRWTGVACNSDHRVTSIFLPNKNLTGYLPSELGAILSLRHLSLYNNNFSKLIPDHLFNATNLLSIDLSHNHLTGPIPEKITSLKFLTSLDLSSNFLNGSLPESLSNLTNLSGTLNLSYNQLSGEIPASYGLFQVMVSLDLRHNNLTGKIPLVGSLLNQGPTAFTGNPFLCGFPLETQCSDPEAQNPRTLSNPDTPKDPGSSIGLS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000404 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000404 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:7483663-7492864 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ZAR1: Receptor protein kinase-like protein ZAR1 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程 GO:0010069 zygote asymmetric cytokinesis in embryo sac 生物过程 GO:0010070 zygote asymmetric cell division 生物过程 GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0062207 regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005777 peroxisome 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G66830 ath:AT2G01210 ath:AT2G26730 ath:AT4G34220 ath:AT4G37250 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.727
细胞质0.147
细胞核0.122
内质网0.061
高尔基体0.029
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08263.18LRRNT_223-64 aaPF00069.32Pkinase350-572 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr350-641 aaPF00078.33RVT_1716-850 aaPF13966.12zf-RVT1087-1155 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_000404 | PF08263.18 | LRRNT_2 | 23 | 64 | 8.5e-13 | 49.1 |
| LXL04_000404 | PF00069.32 | Pkinase | 350 | 572 | 4.8e-24 | 85.9 |
| LXL04_000404 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 350 | 641 | 1.7e-23 | 84.0 |
| LXL04_000404 | PF00078.33 | RVT_1 | 716 | 850 | 5.2e-09 | 37.0 |
| LXL04_000404 | PF13966.12 | zf-RVT | 1087 | 1155 | 1.3e-16 | 61.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9ZU46 | 拟南芥 | Receptor protein kinase-like protein ZAR1 | 37.756% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9C9N5 | 拟南芥 | Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g66830 | 36.045% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
C0LGS3 | 拟南芥 | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g37250 | 33.377% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q94C77 | 拟南芥 | Receptor protein kinase-like protein At4g34220 | 31.532% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O48788 | 拟南芥 | Probable inactive receptor kinase At2g26730 | 35.115% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |